人工智能在代码编写方面已经有很大的编写能力,我就把自己的一些使用分享给大家(chatgpt使用需要tizi,最后放了chatgpt镜像)
推荐大家使用kimi(国产的人工智能也好用主要免费)
1.编写生物信息代码
我想利用spades,对我的fastq下机文件进行组装,文件路径为 ~/Desktop/3.R1.fastq ~/Desktop/3.R2.fastq
来看一下输出结果
2.编写python代码批量spades文件
我想用python编写代码,我的fastq文件都是双端测序的,文件全部放在 ~/Desktop/fastqs文件夹,里面的文件数量不详,但是都是成对的,我想批量对他们进行spades组装,并且把输出文件全部放在 ~/Desktop/denovo文件夹下 ,并且把输出文件每一个文件重新命名源文件名R1之前的内容
python的代码比较好懂,其实编写这一段代码完全靠自己是需要一点时间的,它调用了底层的shell.这样就省得一个一个输spades命令或者利用Linux bash命令
当然看不懂代码也没有事(当然是骗你们的,因为chatgpt写代码也经常错,还是需要自己调试一下,python还是很好学的,生成的代码里都哟有注释),但是有了它真的方便了许多
我的所有的组装分析都变写好流程,每次不管有多少个文件,我都是一键让它从头跑到尾,自己啥都不用管,等结果就行
不懂搭建流程的朋友可以留言,我帮你们搭建省心流程,这个真的事半功倍
3.代替R做热图
一种是你让它直接生成R代码,第二种是让他直接做成图发给你
(第二种使用的chatgpt plus版本,目前chatgpt4O免费的也可以)
自己调整色彩方案
chatgpt需要tizi,当然用原版的最好,个人觉得,国内镜像地址分享在下面:
https://free-chat.cn/(这个网站汇总了所有镜像,自己挑一个免费的)
国内的话推荐月之暗面的kimi,很丝滑
不推荐文心一言,真的是百度的产品不喜欢,搜索引擎国内的话用必应推荐