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    评价病原微生物耐药基因与药敏实验(耐药表型)之间的相关性--Kappa系数

    耐药基因我们常将耐药基因制作成一张热图,看某一种微生物是否含有此耐药基因。总会有一种想法,我们是否完全通过基因测序就能够预测该病原的耐药性呢?(...

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    耐药基因的获得与热图构建

    最近刚好写了一篇关于耐药基因相关分析的常规文章,分享一下最近的经验,方便大家借鉴参考我使用的是card,conda 安装abricate工具,写...

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    病原微生物基因测序后的物种鉴定

    每次基因测序下机后似乎工作就已经完成了,但是我这次测的对不对呢?我有没有把样本的顺序弄错了(我相信只要不是全自动的仪器,大家肯定都犯过错,因为有...

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    NCBI 介绍以及参考基因组SRA数据下载大全

    NCBI中常用到的数据功能:1.下载参考基因组 2.下载相关测序数据,构建进化树 1.下载参考基因组 https://www.ncbi.nlm....

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    NextClade --病毒分析分型利器

    大家肯定都听说过新冠病毒分型,像什么包括阿尔法、贝塔、德尔塔、奥密克戎变异株BA.2.12和BA.2.12.1。。。。这些分型是怎么来的? 基因...

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    生物信息流程构建--Nextflow介绍

    Nextflow Nextflow 由 Paolo Di Tommaso 于 2013 年开发,他是一位计算生物学家和软件工程师。当时 Paol...

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    window下的全能生信分析利器--Docker Desktop初体验--window系统下使用SPAdes进行基因组组装

    docker相较于conda做生信分析有很多优势,尤其是在生信流程的搭建,多系统的支持移植性。但Docker学习难度有点高,需要花时间来学习。对...

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    window下的全能生信分析利器----Docker介绍

    很多人肯定很苦恼,自己的电脑是window系统,很多生信软件不支持window系统,这种情况下只能利用虚拟机装一个完整的Linux系统,虚拟机又...

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    初识Linux操作系统--生物信息软件的家。为什么生信软件大多在Linux下运行

    1. 什么是Linux操作系统? Linux是一种开源的操作系统,最初由Linus Torvalds于1991年发布。与其他操作系统(如Wind...