使用Image J计算单克隆数量

1 用扫描仪扫描六孔板


2 用PS打开进行矫正


3,运行动作”六孔板“截成单个孔


4、将单个孔图片用Image J打开


5、process-batch--macro

程序设置为

run("8-bit");

//run("Brightness/Contrast...");

run("Enhance Contrast", "saturated=0.35");

setAutoThreshold("Default dark");

//run("Threshold...");

setAutoThreshold("Default dark");

//setThreshold(139, 255);

setOption("BlackBackground", false);

run("Convert to Mask");

setAutoThreshold("Default dark");

run("Analyze Particles...", "size=50-1000 show=Outlines display summarize");

将Input和output改为自己想要的地址,运行process


6 将得到的数据保存并进行处理即可,其中Count即为单克隆计数结果。


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