高通量表达谱分析有哪几种?
当前,随着拟南芥,水稻等基因组测序的完成以及完整的人类基因组序列即将译解,人类正在从“结构基因组时代”步入“功能基因组时代”。面对大量的信息,近年来发展了多种分析基因表达差异的高通量技术,分析方法主要包括:
1.表达序列标签(EST)比较测序
EST通常是长约150~500 bp的基因表达序列片段,1个EST代表生物体某种组织某一时期的1个表达基因EST技术是1991年建立起来的一种相对简便和快速鉴定大批表达基因的技术。它是将mRNA反转录成cDNA并克隆到载体构建成cDNA文库后.大规模随机挑选cDNA克隆,对其5 或3 端进行一步法测序。所获序列与基因数据库已知序列比较.从而获得对生物体生长发育、遗传变异、衰老死亡等的信息。
2.基因芯片基础上的方法(例如cDNA微阵列);
3.消减克隆,如代表性差异分析(RDA);
4.差异展示(DD);
5.基因表达系列分析(SAGE)
6.DNA芯片