R语言——生信入门第一步
生信技能树数据挖掘课程学习笔记
一、R与Rstudio
1.什么是R？
2.什么是RStudio？R语言的集成开发环境
3.如何在RStudio中新建项目（R project）
File→New Project→New Directory→New Project→Directory name→Create Project
4.新建脚本
File→New File→R Script
5.RStudio界面介绍
| 脚本编辑器 | environment（对象/变量列表)、history（历史命令) |
|---|---|
| 控制台 | 文件/图片/帮助/包 |
6.字号设置
Tools→Global Options →Appearance →Editor Font size
7.与R“交互”的两种方式
用户--发送命令 R --执行并返回结果
（1）控制台窗口
（2）脚本编辑器 脚本的运行方式1.逐行运行 2.选中运行 快捷键：mac是cmd+enter
注释： 使用“#”为脚本添加注释。让自己和其他协作者了解代码的用途。 R自动忽略“#”右侧的任何内容
保存：1.保存+命名 （.R结尾）2.关闭
保存位置：脚本、数据、图片的默认保存位置，也是文件读取的默认位置—工作目录
R语言的几类命令响应
- 输出结果：命令运行结果、图片 ……
- 报错：Error：检查命令、检查环境、修正后重新运行
- 警告：Warning：忽略、后面如有报错或意外结果再检查
- “没反应”：出现大于号，表示已运行完成
- 命令正在运行：中止（点击红色键）或等待
- 命令不完整：补全命令或按ESC键退出
- 出现提示信息：检查是否有error，没有就可以忽略
- 进一步选择：不回答就一直问，后面的代码无法运行
