Aspera安装及文件上传详细教程
1.下载IBM Aspera软件，官方网址：https://www.ibm.com/aspera/connect/
首先安装拓展，再安装程序
2.开始安装 点击下一步 接受条款，继续下一步 选择典型或者自定义都可以，对一般使用没有影响，然后下一步 点击安装 等待安装完成即可 3.安装已经完成，现在需要找到安装文件夹 默认一般为：C:\Users\用户名\AppData\Local\Programs\Aspera
3.windows+R 搜索打开cmd命令行窗口
4.输入命令 cd 【该软件的绝对位置】
cd C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\IBM\Aspera Connect\bin
5、下载key file到含有ascp的目录【该软件的绝对位置（跟这个位置一样）】
6、将上传的文件放在一个文件夹里面，并记录该文件夹的绝对路径
7、输入上传命令
ascp-i./"aspera.openssh"-QT-l100m-k1-d E:\PBMC_DATA\raw_data subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/zxz1006_gzucm.edu.cn_k7sPagMF
需要修改的地方第一个是NCBI给你的路径，数据储存的文件路径
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上述方法尝试了下，但是我找不到我的安装路径
第二种方法：下载linux版本的aspera
点击查阅所有安装
下载不同版本aspera
出现ascp: /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6: version `GLIBC_2.28' not found问题找到兼容的那一版aspera进行下载
解压 tar -xvf ibm-aspera-connect_4.2.0.42_linux.tar.gz
运行./ibm-aspera-connect_4.2.0.42_linux.sh
输入上传命令ascp-i./"aspera.openssh"-QT-l100m-k1-d E:\PBMC_DATA\raw_data subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/zxz1006_gzucm.edu.cn_k7sPagMF
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aspera下载文件，下载SRA数据
# 下载
wget https://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/downloads/connect/latest/bin/ibm-aspera-connect_4.2.13.820_linux_x86_64.tar.gz
# 解压
tar xvf ibm-aspera-connect******.tar.gz
# 解压后得到一个脚本文件，运行该脚本，即可完成自动安装
bash ibm-aspera-connect*******.sh
# 所有安装文件都在~/.aspera/connect目录下，在 ~/.bashrc添加环境变量
export PATH=~/.aspera/connect/bin/:$PATH
# 使环境变量生效
source ~/.bashrc
ascp -vQT -l 500m -P33001 -k 1 -i \
~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \
era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR122/079/SRR12207279/SRR12207279_1.fastq.gz ./
conda 安装aspera,安装在某个环境内
conda install -c hcc aspera-cli
ascp -vQT -l 500m -P33001 -k 1 -i 环境目录/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR122/079/SRR12207279/SRR12207279_1.fastq.gz ./
