Day7-hongh

测序知识

测序过程和原理

一代测序

  • 双脱氧终止反应法:ddNTP,3‘端无羟基

二代测序

  • 构建文库
  • 桥式PCR
  • 测序
  • 读取index/barcode
  • 双向测序

三代测序

  • 纳米孔测序,SMRT技术

都有哪些类型的测序

基因组学(核酸序列分析)

  1. 全基因组测序(WGS)
  2. 全外显子组测序(WES)
  3. 简化基因组测序(RRGS)
    • RAD-Seq
    • GBS
    • 2bRAD
    • ddGBS(也就是ddRAD)

转录组学(基因表达分析)

  1. mRNA-Seq
  2. IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
  3. sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)

蛋白质组学

  1. 蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
  2. 构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
  3. 蛋白质结构功能预测
  4. 蛋白质连锁图

代谢组学

  1. 代谢物指纹分析
  2. 代谢轮廓分析


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