测序知识
测序过程和原理
一代测序
- 双脱氧终止反应法:ddNTP,3‘端无羟基
二代测序
- 构建文库
- 桥式PCR
- 测序
- 读取index/barcode
- 双向测序
三代测序
- 纳米孔测序,SMRT技术
都有哪些类型的测序
基因组学(核酸序列分析)
- 全基因组测序(WGS)
- 全外显子组测序(WES)
- 简化基因组测序(RRGS)
- RAD-Seq
- GBS
- 2bRAD
- ddGBS(也就是ddRAD)
转录组学(基因表达分析)
- mRNA-Seq
- IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
- sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)
蛋白质组学
- 蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
- 构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
- 蛋白质结构功能预测
- 蛋白质连锁图
代谢组学
- 代谢物指纹分析
-
代谢轮廓分析