240 发简信
IP属地:浙江
  • Resize,w 360,h 240
    批量下载TCGA所有数据

    这是UCSC xena 页面 https://xenabrowser.net/datapages/[https://xenabrowser....

  • Resize,w 360,h 240
    多种方法实现基因ID SYMBOL 与 ENTREZID转换

    方法一 ID转换,ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型(针对clusterProfiler)ID转换用到的是bitr()函数,但我的SY...

  • featureCounts 得到的counts计算 cpm、 tpm、FPKM

    一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言,RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到的上游软件就是featureCounts和...

  • Resize,w 360,h 240
    Dapars2 分析可变多聚腺苷酸化(APA 3’UTR)与肿瘤

    越来越懒了,不想写记录呀!算了,强迫自己一把! 水平有限,若有错误,恳请指出! 信使RNA ( messenger RNA, mRNA)加工过程...

  • Resize,w 360,h 240
    RNA-seq 数据分析最佳实战(综述)

    一篇RNA-seq分析流程的综述,全面而详细!深度好文,可用来反复阅读。初学者用于把握RNA-seq真个流程及各个流程选择上的差异。已经开始学习...

    0.8 7875 0 21
  • Resize,w 360,h 240
    RNA sequencing: the teenage years(中篇)

    前言 这一部分主要涉及常规RNA-seq的数据分析,提到了常见的数据分析流程。 RNA-seq数据分析 用于分析测序读长以确定差异表达的计算方法...

  • Resize,w 360,h 240
    RNA sequencing: the teenage years(下篇)

    前言 这一部分的内容主要涉及单细胞测序,空间转录组,新生RNA测序,翻译组,RNA-RNA之间相互作用,RNA-蛋白质相互作用以及未来展望。 常...

  • Resize,w 360,h 240
    RNA sequencing: the teenage years(上篇)

    《RNA sequencing: the teenage years》这篇综述翻译了一下,全篇汉字大约是3万字,比较长,为了方便阅读,把它拆成3...

  • RNA-seq转录组名词解释基础

    2019年7月24日,Nature Reviews Genetics上发表了一篇了RNA-seq的综述,文献信息如下所示: Stark, R.,...