作者，Evil Genius~~ 空间转录组的运用方向：转录、蛋白 ST最适合回答三种生物问题：首先可以阐明组织的细胞类型组成；第二类问题与细胞相互作用有关；最后可以帮助阐明...
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空间转录组的几个分析要点及经典文献分享 -
2024年了, 都哪些组织有空转数据(人类篇)一、写在前面： 之前给大家整理过类似的合集话题： 2022年了，都有哪些器官/组织有scRNA-Seq数据|小鼠篇[http://mp.weixin.qq.com/s?__b...
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MISTy：空间转录组细胞互作分析方法1. 简介 MISTy主要有四个功能： 算法：Multi-view framework to dissect effects related to CCI (剖析与细胞-细胞...
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ggplot2绘制单细胞经典火山图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
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文献学习069--[sc+st]单细胞和空间转录组分析揭示结直肠癌中FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的相互作用作者通过整合分析scRNA-seq数据、公开发表的scRNA-seq和bulk RNA-seq数据集、空间转录组数据、FACS、IF和免疫治疗的转录组数据，证实FAP+成纤维...
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空间转录组合作项目分析示例(二)作者，Evil Genius 这一篇我们继续合作项目的分析示例，我们在了解了空间转录组的整体分析内容之后，就需要开始针对我们自己的数据进行有效分析，注意是有效分析，就是大家分...
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空间转录组去卷积分析工具介绍——CARD简介 目前，单细胞技术发展迅速，单细胞转录组测序可以帮助我们获得组织中每个细胞的基因表达水平，但却无法获得对应空间位置上的信息。空间转录组技术（spatial trans...
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CARD 空间转录组和单细胞转录组之间的反卷积首先附上参考文献：《Spatially informed cell-type deconvolution for spatial transcriptomics》[https...
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最新12+单细胞生信，探索DAB2+ Macro与FAP+ CAFs关系，高端生信值得模仿！影响因子：12.4 研究概述：肝癌是全球第三大致癌死亡的原因，也是第六大常见的肿瘤类型。其中，肝细胞癌（HCC）为最常见的肝癌类型，其次为肝内胆管癌（ICC），这两种类型合计...
