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1、员工角色区分的薪资管理解决方案
三九医药在员工的薪资管理方面严格根据员工的编制状态区分为 两个管理集群。针对这一特点，系统采用如下的处理方式：不同的群 组针对不同的员工进行管理，相互间信息没有交叉，保证了薪资数据 不外泄；不同的群组间采用不同的薪资管理体系，采用不同的薪资项 目定义与发放策略定义，保证可以灵活地定制两个群组自身的特定薪 资管理内容；对于不同的群组提供不同的报表分析结果，用信息的划 分来得到不同的数据，企业管理者可以有针对性地得到两个群组的薪 资成本统计，以帮助决策。
2、全新的绩效管理流程
针对咨询结果，三九医药定制了有自己特色且对于企业发展有利的 绩效管理理论与流程。在这样的流程中更强调员工的参与、主管人员与 员工间的交流与互动，让绩效管理不只停留在案头与书面，而是在企业 运作的各个时刻，所有人员都在执行与努力完成企业的绩效目标。
3、体现员工参与的培训管理解决方案
三九医药的培训管理具有灵活性高、员工参与性高的特点，一次 培训也许完全是由员工自愿参加的，而在此过程中人力资源管理者只是对培训过程进行侧面的规划与管理。因此，针对这一特点，设计了更加合理与高效的培训管理流程。
4、自定义的自助风格与员工角色
三九医药人力资源系统中为企业提供了以下几种用户角色：人力资源管理者、普通员工、直线经理、公司领导与CEO。用户可以 根据管理权责的划分来灵活设置使用此系统的人员的身份。同时对 于每一种身份，系统均充分考虑到用户的特点。
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