IncRNA和circRNA 的研究套路

IncRNA:长链非编码RNA,是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。近年来的研究表明IncRNA能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达,参与X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系。

研究流程:
1.先证明这个RNA是非编码RNA (自己筛需要,难度很高,可以找现成的套新的表型和机制)
查IncRNA的序列:NONCODE数据库
看其有没有超过100个碱基序列的ORF
若是circRNA还需证明是环状的

其他的和miRNA的研究套路完全相同
2.表达差异
qPCR
3.制备基因操作工具
细胞核定位的用基因编辑技术:基因敲除
细胞质定位用RNAi技术,因为siRNA 主要是在细胞质发生作用
4.细胞表型实验
模法标套路
5.动物表型实验
6.rescue验证
在同一个细胞里先做过表达看表型然后做沉默看表型

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