安装Conda环境

一、安装 Miniconda(如果conda没有安装)

如果还没有安装conda,可以先下载并安装 Miniconda:


安装 Miniconda 的步骤如下:

1. 下载  Miniconda 安装脚本使用 wget 命令从官方源下载 Miniconda 安装脚本:

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh


2. 开始安装:

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh


3. 安装过程中会要求您阅读并接受许可协议:

① 按 Enter 键继续查看协议。

② 输入 yes 并按 Enter 以接受协议。

如图所示

即可~

4. 选择安装路径系统会提示安装路径(默认是 ~/miniconda3)。

① 直接按 Enter 使用默认路径(默认是 ~/miniconda3)

② 或输入自定义路径。

5. 初始化 Conda安装完成后,系统可能会询问是否要将 conda 添加到系统路径中(即初始化 conda)。

① 输入 yes 并按 Enter。

如图所示:

6. 重载 .bashrc 完成安装后,执行以下命令,以更新当前会话的路径:

source ~/.bashrc


7. 验证安装检查 conda 是否已成功安装:

conda --version(如果显示类似 conda 24.9.2 的版本信息,则安装成功)


8. 安装成功后,就可以使用conda创建和管理环境了

例如:

conda create -n myenv python=3.8conda activate myenv

这样就完成了 Conda 的安装和配置

9. 现在可以使用 conda 来创建和管理虚拟环境,并安装所需的 Python 包和依赖

例如,可以创建并激活一个新的环境:

conda create -n myenv python=3.8

conda activate myenv


这样,可以在新的 Conda 环境中安装和使用所需的软件包,而不会影响系统的全局环境。



二、创建(如果本来有 Conda 环境,想重开新窗口)

在 Linux 上,可以使用 tmux 或 screen 来创建一个新的会话窗口。


下面分别介绍一下

1、在 Linux 上,使用 tmux 创建新会话并运行代码

如果尚未安装 tmux,可以使用以下命令安装:

sudo apt update

sudo apt install tmux


步骤

①、创建新的 tmux 会话

tmux new -s mysession(这里的mysession是会话名称,可以替换为任意名称。)

②、在新会话中运行代码:在tmux会话窗口中输入您的代码命令,例如运行 Python 脚本:

python 1.py

③、退出但保持会话运行

按Ctrl + b,然后按d键,将tmux会话置于后台继续运行。

④、可以关闭终端,而代码会继续运行在后台。

重新连接到 tmux 会话:要返回到之前的tmux会话,使用以下命令:

tmux attach -t mysession



2、使用screen创建新会话并运行代码

安装:

sudo apt update

sudo apt install screen

步骤

①、创建新的 screen 会话

screen -S mysession(mysession是会话名称,可以根据需要更改)

②、在新会话中运行代码:输入您的代码运行命令,例如:

python your_script.py

③、退出但保持会话运行

按Ctrl + a,然后按d键,将screen会话置于后台运行。

④、重新连接到 screen 会话:要返回到screen会话,运行:

screen -r mysession


额外提示

查看所有 tmux 会话:tmux ls

查看所有 screen 会话:screen -ls



生物信息学领域非常广泛,难以一次说尽。我们下次继续更新,一起深入学习生物信息学的内容!

喜欢的宝子们点个赞吧~码字不易,且行且珍惜~

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