基因id转换

gene symbol 与 entrezid 转换

library(clusterProfiler)
library(org.Mm.eg.db)
deg <- read.csv("WT-VS-KO.csv")
head(deg)[1:3,1:11]
#id转换
entrezid <- bitr(deg$GeneSymbol,fromType = "SYMBOL",toType = "ENTREZID",OrgDb = "org.Mm.eg.db",drop = T)
#fromType是指你的数据ID类型是属于哪一类的
#toType是指你要转换成哪种ID类型，可以写多种，也可以只写一种
#Orgdb是指对应的注释包是哪个
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