龙舌兰根际细菌多样性和相互作用网络与Cuatro Cienegas寡养盆地块状土的显著差异
Nguyen E. López-Lozano1*, Andrea Echeverría Molinar1, Elizabeth Alejandra Ortiz Durán2, Maribel Hernández Rosales3† and Valeria Souza4
统计分析Shapiro-Wilk检验用于检验数据的正常性。如果没有正态分布，则应用数据转换。使用Pearson方法进行土壤物理化学性质的自相关分析。然而，没有一个属性呈现出显着的自相关。之后，为了寻找土壤类型（根际或块状土壤）和季节之间的差异，以及两个变量之间的相互作用，使用双向ANOVA。为了验证模型拟合，评估了残差的正态性假设。作为对那些表现出显着差异的属性的事后评估，应用了Tukey测试。这些分析是使用R软件v 3.4.0进行的。，用于所有后续分析。使用基于Bray-Curtis相异指数的非度量多维标度（NMDS）方法进行排序分析，对于所有分析，仅考虑相对丰度大于1%的属。应用非生物变量的环境拟合分析（土壤的物理化学性质）。这些计算是用纯素包装和ggplot2包装进行的。使用gplots包构建热图，其聚类分析基于Bray-Curtis不相似性指数。PERMANOVA分析使用纯素包装中的功能adonis2进行。
