BioCyc数据库简介

一、介绍

1.BioCyc

BioCyc是代谢途径的数据库集合,集合中的每个数据库描述了单个生物体的基因组和代谢途径(MetaCyc是来自代谢途径的参考来源),包括反应、酶、基因和底物化合物。第一层数据库包含EcoCyc、MetaCyc和BOCD,第二层和第三层数据库则包含了计算预测代谢通路,以及哪些基因编码代谢通路中缺少酶的预测和预测的操纵子。BioCyc提供的分析工具包括:基因组浏览器、个体代谢通路和完整代谢图的显示等。
https://humancyc.org/publications.shtml#
http://metacyc.ai.sri.com/PToolsWebsiteHowto.shtml#SearchHelp

2.MetaCyc

MetaCyc数据来源科学实验文献,为代谢通路和酶提供了大量的参考信息,含有初生代谢和次生代谢通路,还包括相关的化合物、酶和基因。Metacyc是一个多有机体数据库,其他生物数据库描述单个生物体的代谢网络和基因组,并将实验确定的路径与计算预测的路径混合。Metacyc仅包含实验阐明的途径。
MetaCyc的应用:查询代谢通路、预测基因组测序中的代谢通路、通过酶数据库支持代谢通路。

二、使用

image.png

参考:
1.国基还未中?你与国基之间可能就差这么几个数据库!!

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容