关于WGCNA的分析,共有3期
教程,今天是的第三期。前面两期是使用代码进行分析的,也是我们的平时最常用的分析方法,对我个人来说也是最简洁的方法。(PS:对于使用代码分析,个人有个人的看法。如果你看得懂代码,那么是非常方便的;但是,一旦你遇到超出你能力范围的代码,就需要你获得别人的帮助
)
[WGCNA分析教程二]((https://mp.weixin.qq.com/s/Ln9TP74nzWhtvt7obaMp1A)
我们的前面两个教程是付费
教程,对于这个价格是否值得,就是仁者见仁,智者见智
。
上面的教程,所有代码都原封不动的附上,只需改动几个参数就可以;如果,你连需要改那几个参数都不知道,那么请看我每个教程的视频解析;那么,仍然不知道,我们也没办法了
今天的教程是来自TBtools | 零基础掌握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,作者已经提供了详细的使用教程,也是非常方便的。直接按照作者的操作分析即可。你考虑的问题,作者大佬都给你考虑到了!!
具体请自己详细看一下。
作者代码存放位置:在GitHub中(https://github.com/ShawnWx2019/WGCNA-shinyApp)
自己使用作者教程安装时遇到的问题
我们在TBtools使用WGCNA shiny
插件,启动后会进行安装相关的包,但是也许我的环境问题,一直安装不上,出现报错的情况。
当你遇到这样的情况,我们最好的解决办法就是直接使用作者的代码在
Rstudio
中的运行即可,运行成功后直接跳出可视化操作框。运行成功后的界面
那么后的操作就按作者的教程进行即可TBtools | 零基础掌握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,但是,很多的操作还是需要自己来摸索。
前面WGNCA的教程:
小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学的教程,以及基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!