这是一部小成本制作而成的经典科幻悬疑电影。3200万美元的成本打造了一个环环相扣、跌宕起伏、脑洞大开的精彩故事。节奏十分紧凑，矛盾冲突此起彼伏，台词出彩，各个人物的形象分外分明，男女主角的感情戏温馨动容，不温不火，恰到好处，科幻概念独树一帜别出心裁却并不生涩，即使对科幻毫无兴趣的观众也会被该片非凡的魅力所感染，情不自禁一看到底，诚心慨叹。
影片一开头就以斯蒂文斯在火车上突然惊醒的茫然为引子，拉开了一个悬念迭起的故事讲述：斯蒂文斯变成了另一个名叫肖恩的历史学教授，克里斯汀娜是肖恩教授的女朋友，斯蒂文斯不明白在自己身上究竟发生了什么？他不认识现在的自己，也不认识克里斯汀娜和火车上的所有人。疾驰的火车上装有一枚恐怖分子的炸弹，爆炸发生在这列火车上，火车上无一人生还。斯蒂文斯在爆炸后回到了一个密闭仓库中，在这个仓库中他渐渐了解到自己其实已经死了，但拉特里奇博士用发明的“源代码”装置留住了斯蒂文斯的未被毁灭的脑电波，再用脑电波的方式实现与其对话。
拉特里奇博士为了金钱名利反复榨取斯蒂文斯脑电波中仅存的无上价值-----利用“源代码“反复穿越到爆炸的火车上去获取恐怖分子的信息，以阻止恐怖分子下一场草菅人命的变态计划。拉特里奇博士将斯蒂文斯当成了自己功成名就的工具，在他眼里，斯蒂文斯只是“时钟上的指针”，只能按照他的意志来运转，所有与任务无关的事情都必须被清除。戈德温上尉因为同情斯蒂文斯的遭遇，又感佩他所作出的贡献，同时也极端反感拉特里奇博士的人格，她最终按下了生命终止程序，让斯蒂文斯带着生命最后的尊严微笑死去。但源代码的故事并未结束，影片给观众留下了一个巨大的悬念，斯蒂文斯在现实世界中的确已“寿终正寝”，但用源代码传输的方式将斯蒂文斯的脑电波赋予到肖恩博士的身上，作为与现实世界平行的源代码世界的肖恩却并未死去。
在源代码的世界中，他与克里斯蒂娜在阳光熠熠的上午幸福的并肩而行，最后同行至一处巨大的镜面雕塑前静静凝望镜面雕塑中的世界，这个镜头也许是在告诉我们：源代码的世界并不是虚拟的！而是真实存在的。
它们就像镜子映出的两面，真实与虚幻都是相对而生，死亡并不是生命的终结，脑电波也不会永远消散，生命可以以另一种不可思议的方式继续进行，而在那样一个不为人知的世界里，也一样拥有着现实世界中必不可少的一切-----幸福、欢笑、感动，或者美好。
斯蒂文斯是在阿富汗的战争中不幸罹难的，作为飞行员的他对父亲有着深深的愧疚和思念，所以化身为肖恩的斯蒂文斯在火车上利用仅有的八分钟以斯蒂文斯战友的身份给父亲打了一个慰问电话，却还不能透露出此时此刻难以言说的身份，这通电话让影片中的情感元素骤然凝聚，时间被自然延长，肖恩时不时微笑而伤感地望望火车下一无所知的克里斯蒂娜的美丽的脸，心里五味陈杂，百感交集。是幸福吗？是伤感吗？抑或是一种将死的无能为力？没人说得清楚，因为他现在既不是斯蒂芬斯，也不是肖恩教授，只是一个虚拟的执行任务的工具。在源代码的世界里，他应该制造感情吗？影片其实在这里从侧面抨击了战争的罪恶和残酷，本是人世间最质朴最平常的情感流露，可到了斯蒂芬斯这里，却变成了最奢侈最遥不可及的幻梦，与父亲的通话只能穿越生死虚妄的时空间隔，只有现场观众才能深切体会到这种催人泪下的极度创痛。
影片最后戈德温收到的那条肖恩发来的短信成了影片最难以解释的疑团：肖恩到底是活着还是死了？如果死了，那短信到底是谁发的？如果没死，那实验室里躺着的那个尸体又是谁呢？或者，斯蒂文斯的脑电波移植到肖恩的身上，但肖恩在那场大爆炸中已经死了，化身后的肖恩是拥有斯蒂文斯记忆的新个体，这个个体只存在于源代码所创造的世界里，这个世界就叫美丽新世界，而它与现实世界中的联系，可以通过电磁波相连。这就是平行世界的含义。
