使用服务器进行eggnog-mapper非模式植物蛋白注释
1、软件下载
mkdir database
cd database
git clone https://github.com/jhcepas/eggnog-mapper.git
2、数据库下载
我是先在网页下载好以后，转移到服务器
http://eggnog5.embl.de/download/emapperdb-5.0.2/
/database/eggnog_data_dir/eggnog-mapper/data 放置在data目录下，并且解压所有文件
3、使用
python3 /database/eggnog_data_dir/eggnog-mapper/emapper.py --cpu 80 -i XXX.protein.fa -o XXX -d euk
euk对应真核生物，bact对应细菌, arch对应古细菌(Archeabacteria), 以及一个病毒数据库(viruses)
4、结果文件
XXX.emapper.annotations
