数学、计算机与生命科学交叉科学青年学者论坛已经举办第七届了,七年来,我想每年的这个时候,不管是举办方还是参会人员都有新的感触。这是我第一次参与这个论坛,上层建筑当然是想看看外面的世界了,感受一下大牛的气氛,经济基础就是冲着论坛不收注册费而且提供免费的午餐。中国科学院的午餐岂是免费能吃到的?
论坛是由中国科学院数学与系统科学研究院、中国科学院国家数学与交叉科学中心、中国科学院遗传与发育生物学研究所主办的,其实你到现场之后就会发现,这是一场生物信息学的论坛。本届会议由中国科学院数学与系统科学研究院/国家数学与交叉科学中心与中国科学院遗传与发育生物学研究所主办,中国运筹学学会计算系统生物学分会、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会、中国科学院青年创新促进会协办。会议组织者热诚欢迎从事相关研究的广大青年科学家与研究生参会。听众多是青年研究生、博士生,今年到场的人数又刷新记录大约有700人。
第一天的会议日程如下:
会场的气氛还是比较愉快的,主要是大家都是慕名而来,而且报告也确实精彩,不光是内容形式也很好,比如大部分教授还是比较幽默的。而且个别老师还挺有家国情怀,特别提到在中美关系僵持的当下,我们中国生命科学的“备胎计划”。当然,有没有我们并不知道。我想,每一次我们传承都是一种备胎。
黄三文老师开篇提到他在基因组育种方面的经历,我觉得他是现场最能调动气氛的,因为他一直在谈论吃的。比如他的一张PPT:
他是做番茄、黄瓜、马铃薯育种的,他说:如果马铃薯能在非洲种植,解决了非洲人民的温饱问题,下一步非洲人民就可以买华为手机了。
之前并不知道这位老师,查了一下:国家科技奖获得者黄三文:用基因测序技术寻找不苦的黄瓜.
汤超老师讲的就比较偏理论了,主要是讨论细菌获取碳源的策略,讲了很多数学的理论,米氏方程了,求极值啊。有趣的是,细菌在生活中常常处在营养过饱和的状态,他们是如何控制自己的温饱的?又是如何在同时面临那么多的食物的时候,选择先吃哪个后吃哪个的呢?汤老师,把它们翻译为数学语言给予了推导,很有意思的工作。
李霞老师就厉害了,是她在国内第一个建立生物信息学专业学科。本科念数学,研究生学习计算机,博士读生物。李老师倒是没讲多少技术方面的东西,主要是回顾自己的数学生涯,以及数学在生命科学的应用。可以体会到她是真的喜欢数学的人 。
然后就是汤神了。汤富酬老师在2009年开发出单细胞测序技术,一直以来在这个领域深耕,在生命发育方面给了我们许多新的理解。会后有很多学生围着他问问题,细胞群的定义,肿瘤细胞异质性,细胞类型验证他都给了比较详细的解答。关于亚群的定义,汤神提示我们:一个亚群到底是一个新的细胞类型还是一个细胞类型的不同状态,这是非监督聚类这技术解决不了的,需要做染色切片来验证。另外,为了确保亚群是有意义的,最好做重复实验。
可以看到呢?今天的讲座由三分之一以上的报告主题都是和单细胞有关的,可见主委会对这项技术的重视。汤神在PPT的最后,对单细胞研究提出了自己的期望:
当然,后面的报告也很精彩,因为时间的关系我就不再逐一回顾了。想深入了解的,可以根据老师的名字和报告主题关键字去检索它们的论文来看。看paper和听写paper的人讲paper是不同的。
这是明天的报告:
明天我就不再北京了。有机会的话还是去见一见你们领域的大牛吧,吃牛肉,还要知道牛长什么样子。要知道,科研也是一种文化现象,多多参与科研活动,不要成为paper机器人。enjoy yourself.