通过前面几章的学习,我们已经掌握了PyTorch中大部分的基础知识,本章将结合之前讲的内容,带领读者从头实现一个完整的深度学习项目。本章的重点不在于如何使用PyTorch的接口,而在于合理地设计程序的结构,使得程序更具可读性、更易用。
6.1 编程实战:猫和狗二分类
在学习某个深度学习框架时,掌握其基本知识和接口固然重要,但如何合理组织代码,使得代码具有良好的可读性和可扩展性也必不可少。本文不会深入讲解过多知识性的东西,更多的则是传授一些经验,这些内容可能有些争议,因其受我个人喜好和coding风格影响较大,读者可以将这部分当成是一种参考或提议,而不是作为必须遵循的准则。归根到底,都是希望你能以一种更为合理的方式组织自己的程序。
在做深度学习实验或项目时,为了得到最优的模型结果,中间往往需要很多次的尝试和修改。而合理的文件组织结构,以及一些小技巧可以极大地提高代码的易读易用性。根据笔者的个人经验,在从事大多数深度学习研究时,程序都需要实现以下几个功能:
- 模型定义
- 数据处理和加载
- 训练模型(Train&Validate)
- 训练过程的可视化
- 测试(Test/Inference)
另外程序还应该满足以下几个要求:
- 模型需具有高度可配置性,便于修改参数、修改模型,反复实验。
- 代码应具有良好的组织结构,使人一目了然。
- 代码应具有良好的说明,使其他人能够理解。
在之前的章节中,我们已经讲解了PyTorch中的绝大部分内容。本章我们将应用这些内容,并结合实际的例子,来讲解如何用PyTorch完成Kaggle上的经典比赛:Dogs vs. Cats。本文所有示例程序均在github上开源 。
6.1.1 比赛介绍
Dogs vs. Cats是一个传统的二分类问题,其训练集包含25000张图片,均放置在同一文件夹下,命名格式为<category>.<num>.jpg
, 如cat.10000.jpg
、dog.100.jpg
,测试集包含12500张图片,命名为<num>.jpg
,如1000.jpg
。参赛者需根据训练集的图片训练模型,并在测试集上进行预测,输出它是狗的概率。最后提交的csv文件如下,第一列是图片的<num>
,第二列是图片为狗的概率。
id,label
10001,0.889
10002,0.01
...
6.1.2 文件组织架构
前面提到过,程序主要包含以下功能:
- 模型定义
- 数据加载
- 训练和测试
首先来看程序文件的组织结构:
├── checkpoints/
├── data/
│ ├── __init__.py
│ ├── dataset.py
│ └── get_data.sh
├── models/
│ ├── __init__.py
│ ├── AlexNet.py
│ ├── BasicModule.py
│ └── ResNet34.py
└── utils/
│ ├── __init__.py
│ └── visualize.py
├── config.py
├── main.py
├── requirements.txt
├── README.md
其中:
-
checkpoints/
: 用于保存训练好的模型,可使程序在异常退出后仍能重新载入模型,恢复训练。 -
data/
:数据相关操作,包括数据预处理、dataset实现等。 -
models/
:模型定义,可以有多个模型,例如上面的AlexNet和ResNet34,一个模型对应一个文件。 -
utils/
:可能用到的工具函数,在本次实验中主要是封装了可视化工具。 -
config.py
:配置文件,所有可配置的变量都集中在此,并提供默认值。 -
main.py
:主文件,训练和测试程序的入口,可通过不同的命令来指定不同的操作和参数。 -
requirements.txt
:程序依赖的第三方库。 -
README.md
:提供程序的必要说明。
6.1.3 关于init.py
可以看到,几乎每个文件夹下都有__init__.py
,一个目录如果包含了__init__.py
文件,那么它就变成了一个包(package)。__init__.py
可以为空,也可以定义包的属性和方法,但其必须存在,其它程序才能从这个目录中导入相应的模块或函数。例如在data/
文件夹下有__init__.py
,则在main.py
中就可以from data.dataset import DogCat
。而如果在__init__.py
中写入from .dataset import DogCat
,则在main.py中就可以直接写为:from data import DogCat
,或者import data; dataset = data.DogCat
,相比于from data.dataset import DogCat
更加便捷。
6.1.4 数据加载
数据的相关处理主要保存在data/dataset.py
中。关于数据加载的相关操作,在上一章中我们已经提到过,其基本原理就是使用Dataset
提供数据集的封装,再使用Dataloader
实现数据并行加载。Kaggle提供的数据包括训练集和测试集,而我们在实际使用中,还需专门从训练集中取出一部分作为验证集。对于这三类数据集,其相应操作也不太一样,而如果专门写三个Dataset
,则稍显复杂和冗余,因此这里通过加一些判断来区分。对于训练集,我们希望做一些数据增强处理,如随机裁剪、随机翻转、加噪声等,而验证集和测试集则不需要。下面看dataset.py
的代码:
# coding:utf8
import os
from PIL import Image
from torch.utils import data
from torchvision import transforms as T
class DogCat(data.Dataset):
def __init__(self, root, transforms=None, train=True, test=False):
"""
主要目标: 获取所有图片的地址,并根据训练,验证,测试划分数据
"""
self.test = test
imgs = [os.path.join(root, img) for img in os.listdir(root)]
# test1: data/test1/8973.jpg
# train: data/train/cat.10004.jpg
if self.test:
imgs = sorted(imgs, key=lambda x: int(x.split('.')[-2].split('/')[-1]))
else:
imgs = sorted(imgs, key=lambda x: int(x.split('.')[-2]))
imgs_num = len(imgs)
if self.test:
self.imgs = imgs
elif train:
self.imgs = imgs[:int(0.7 * imgs_num)]
else:
self.imgs = imgs[int(0.7 * imgs_num):]
if transforms is None:
normalize = T.Normalize(mean=[0.485, 0.456, 0.406],
std=[0.229, 0.224, 0.225])
if self.test or not train:
self.transforms = T.Compose([
T.Resize(224),
T.CenterCrop(224),
T.ToTensor(),
normalize
])
else:
self.transforms = T.Compose([
T.Resize(256),
T.RandomCrop(224),
T.RandomHorizontalFlip(),
T.ToTensor(),
normalize
])
def __getitem__(self, index):
"""
一次返回一张图片的数据
"""
img_path = self.imgs[index]
if self.test:
label = int(self.imgs[index].split('.')[-2].split('/')[-1])
else:
label = 1 if 'dog' in img_path.split('/')[-1] else 0
data = Image.open(img_path)
data = self.transforms(data)
return data, label
def __len__(self):
return len(self.imgs)
关于数据集使用的注意事项,在上一章中已经提到,将文件读取等费时操作放在__getitem__
函数中,利用多进程加速。避免一次性将所有图片都读进内存,不仅费时也会占用较大内存,而且不易进行数据增强等操作。另外在这里,我们将训练集中的30%作为验证集,可用来检查模型的训练效果,避免过拟合。在使用时,我们可通过dataloader加载数据。
train_dataset = DogCat(opt.train_data_root, train=True)
trainloader = DataLoader(train_dataset,
batch_size = opt.batch_size,
shuffle = True,
num_workers = opt.num_workers)
for ii, (data, label) in enumerate(trainloader):
train()
6.1.5 模型定义
模型的定义主要保存在models/
目录下,其中BasicModule
是对nn.Module
的简易封装,提供快速加载和保存模型的接口。
# coding:utf8
import time
import torch as t
class BasicModule(t.nn.Module):
"""
封装了nn.Module,主要是提供了save和load两个方法
"""
def __init__(self):
super(BasicModule, self).__init__()
self.model_name = str(type(self)) # 默认名字
def load(self, path):
"""
可加载指定路径的模型
"""
self.load_state_dict(t.load(path))
def save(self, name=None):
"""
保存模型,默认使用“模型名字+时间”作为文件名
"""
if name is None:
prefix = 'checkpoints/' + self.model_name + '_'
name = time.strftime(prefix + '%Y%m%d%H%M%S.pth')
t.save(self.state_dict(), name)
return name
def get_optimizer(self, lr, weight_decay):
return t.optim.Adam(self.parameters(), lr=lr, weight_decay=weight_decay)
class Flat(t.nn.Module):
"""
把输入reshape成(batch_size,dim_length)
"""
def __init__(self):
super(Flat, self).__init__()
# self.size = size
def forward(self, x):
return x.view(x.size(0), -1)
在实际使用中,直接调用model.save()
及model.load(opt.load_path)
即可。
其它自定义模型一般继承BasicModule
,然后实现自己的模型。其中AlexNet.py
实现了AlexNet,ResNet34
实现了ResNet34。在models/__init__py
中,代码如下:
from .AlexNet import AlexNet
from .ResNet34 import ResNet34
这样在主函数中就可以写成:
from models import AlexNet
或
import models
model = models.AlexNet()
或
import models
model = getattr('models', 'AlexNet')()
其中最后一种写法最为关键,这意味着我们可以通过字符串直接指定使用的模型,而不必使用判断语句,也不必在每次新增加模型后都修改代码。新增模型后只需要在models/__init__.py
中加上from .new_module import new_module
即可。
其它关于模型定义的注意事项,在上一章中已详细讲解,这里就不再赘述,总结起来就是:
- 尽量使用
nn.Sequential
(比如AlexNet)。 - 将经常使用的结构封装成子Module(比如GoogLeNet的Inception结构,ResNet的Residual Block结构)。
- 将重复且有规律性的结构,用函数生成(比如VGG的多种变体,ResNet多种变体都是由多个重复卷积层组成)。
6.1.6 工具函数
在项目中,我们可能会用到一些helper方法,这些方法可以统一放在utils/
文件夹下,需要使用时再引入。在本例中主要是封装了可视化工具visdom的一些操作,其代码如下,在本次实验中只会用到plot
方法,用来统计损失信息。
# coding:utf8
import time
import numpy as np
import visdom
class Visualizer(object):
"""
封装了visdom的基本操作,但是你仍然可以通过`self.vis.function`
调用原生的visdom接口
"""
def __init__(self, env='default', **kwargs):
self.vis = visdom.Visdom(env=env, use_incoming_socket=False, **kwargs)
# 画的第几个数,相当于横座标
# 保存(’loss',23) 即loss的第23个点
self.index = {}
self.log_text = ''
def reinit(self, env='default', **kwargs):
"""
修改visdom的配置
"""
self.vis = visdom.Visdom(env=env, **kwargs)
return self
def plot_many(self, d):
"""
一次plot多个
@params d: dict (name,value) i.e. ('loss',0.11)
"""
for k, v in d.items():
self.plot(k, v)
def img_many(self, d):
for k, v in d.items():
self.img(k, v)
def plot(self, name, y, **kwargs):
"""
self.plot('loss',1.00)
"""
x = self.index.get(name, 0)
self.vis.line(Y=np.array([y]), X=np.array([x]),
win=name,
opts=dict(title=name),
update=None if x == 0 else 'append',
**kwargs
)
self.index[name] = x + 1
def img(self, name, img_, **kwargs):
"""
self.img('input_img',t.Tensor(64,64))
self.img('input_imgs',t.Tensor(3,64,64))
self.img('input_imgs',t.Tensor(100,1,64,64))
self.img('input_imgs',t.Tensor(100,3,64,64),nrows=10)
!!!don‘t ~~self.img('input_imgs',t.Tensor(100,64,64),nrows=10)~~!!!
"""
self.vis.images(img_.cpu().numpy(),
win=name,
opts=dict(title=name),
**kwargs
)
def log(self, info, win='log_text'):
"""
self.log({'loss':1,'lr':0.0001})
"""
self.log_text += ('[{time}] {info} <br>'.format(
time=time.strftime('%Y%m%d %H:%M:%S'),
info=info))
self.vis.text(self.log_text, win)
def __getattr__(self, name):
return getattr(self.vis, name)
6.1.7 配置文件
在模型定义、数据处理和训练等过程都有很多变量,这些变量应提供默认值,并统一放置在配置文件中,这样在后期调试、修改代码或迁移程序时会比较方便,在这里我们将所有可配置项放在config.py
中。
# coding:utf8
import warnings
import torch as t
class DefaultConfig(object):
env = 'default' # visdom 环境
vis_port = 8097 # visdom 端口
model = 'SqueezeNet' # 使用的模型,名字必须与models/__init__.py中的名字一致
train_data_root = './data/train/' # 训练集存放路径
test_data_root = './data/test/' # 测试集存放路径
load_model_path = None # 加载预训练的模型的路径,为None代表不加载
batch_size = 32 # batch size
use_gpu = True # user GPU or not
num_workers = 0 # how many workers for loading data
print_freq = 20 # print info every N batch
debug_file = './debug/debug.txt' # if os.path.exists(debug_file): enter ipdb
result_file = 'result.csv'
max_epoch = 10
lr = 0.001 # initial learning rate
lr_decay = 0.5 # when val_loss increase, lr = lr*lr_decay
weight_decay = 0e-5 # 损失函数
def _parse(self, kwargs):
"""
根据字典kwargs 更新 config参数
"""
for k, v in kwargs.items():
if not hasattr(self, k):
warnings.warn("Warning: opt has not attribut %s" % k)
setattr(self, k, v)
opt.device = t.device('cuda') if opt.use_gpu else t.device('cpu')
print('user config:')
for k, v in self.__class__.__dict__.items():
if not k.startswith('_'):
print(k, getattr(self, k))
opt = DefaultConfig()
可配置的参数主要包括:
- 数据集参数(文件路径、batch_size等)
- 训练参数(学习率、训练epoch等)
- 模型参数
这样我们在程序中就可以这样使用:
import models
from config import DefaultConfig
opt = DefaultConfig()
lr = opt.lr
model = getattr(models, opt.model)
dataset = DogCat(opt.train_data_root)
这些都只是默认参数,在这里还提供了更新函数,根据字典更新配置参数。
def _parse(self, kwargs):
"""
根据字典kwargs 更新 config参数
"""
for k, v in kwargs.items():
if not hasattr(self, k):
warnings.warn("Warning: opt has not attribut %s" % k)
setattr(self, k, v)
opt.device = t.device('cuda') if opt.use_gpu else t.device('cpu')
print('user config:')
for k, v in self.__class__.__dict__.items():
if not k.startswith('_'):
print(k, getattr(self, k))
这样我们在实际使用时,并不需要每次都修改config.py
,只需要通过命令行传入所需参数,覆盖默认配置即可。
例如:
opt = DefaultConfig()
new_config = {'lr':0.1,'use_gpu':False}
opt.parse(new_config)
opt.lr == 0.1
6.1.8 main.py
在讲解主程序main.py
之前,我们先来看看2017年3月谷歌开源的一个命令行工具fire,通过pip install fire
即可安装。下面来看看fire
的基础用法,假设example.py
文件内容如下:
import fire
def add(x, y):
return x + y
def mul(**kwargs):
a = kwargs['a']
b = kwargs['b']
return a * b
if __name__ == '__main__':
fire.Fire()
那么我们可以使用:
python example.py add 1 2 # 执行add(1, 2)
python example.py mul --a=1 --b=2 # 执行mul(a=1, b=2), kwargs={'a':1, 'b':2}
python example.py add --x=1 --y==2 # 执行add(x=1, y=2)
可见,只要在程序中运行fire.Fire()
,即可使用命令行参数python file <function> [args,] {--kwargs,}
。fire还支持更多的高级功能,具体请参考官方指南《The Python Fire Guide》。
在主程序main.py
中,主要包含四个函数,其中三个需要命令行执行,main.py
的代码组织结构如下:
def train(**kwargs):
"""
训练
"""
pass
def val(model, dataloader):
"""
计算模型在验证集上的准确率等信息,用以辅助训练
"""
pass
def test(**kwargs):
"""
测试(inference)
"""
pass
def help():
"""
打印帮助的信息
"""
print('help')
if __name__=='__main__':
import fire
fire.Fire()
根据fire的使用方法,可通过python main.py <function> --args=xx
的方式来执行训练或者测试。
训练
训练的主要步骤如下:
- 定义网络
- 定义数据
- 定义损失函数和优化器
- 计算重要指标
- 开始训练
- 训练网络
- 可视化各种指标
- 计算在验证集上的指标
训练函数的代码如下:
def train(**kwargs):
opt._parse(kwargs)
vis = Visualizer(opt.env, port=opt.vis_port)
# step1: configure model
model = getattr(models, opt.model)()
if opt.load_model_path:
model.load(opt.load_model_path)
model.to(opt.device)
# step2: data
train_data = DogCat(opt.train_data_root, train=True)
val_data = DogCat(opt.train_data_root, train=False)
train_dataloader = DataLoader(train_data, opt.batch_size,
shuffle=True, num_workers=opt.num_workers)
val_dataloader = DataLoader(val_data, opt.batch_size,
shuffle=False, num_workers=opt.num_workers)
# step3: criterion and optimizer
criterion = t.nn.CrossEntropyLoss()
lr = opt.lr
optimizer = model.get_optimizer(lr, opt.weight_decay)
# step4: meters
loss_meter = meter.AverageValueMeter()
confusion_matrix = meter.ConfusionMeter(2)
previous_loss = 1e10
# train
for epoch in range(opt.max_epoch):
loss_meter.reset()
confusion_matrix.reset()
for ii, (data, label) in tqdm(enumerate(train_dataloader)):
# train model
input = data.to(opt.device)
target = label.to(opt.device)
optimizer.zero_grad()
score = model(input)
loss = criterion(score, target)
loss.backward()
optimizer.step()
# meters update and visualize
loss_meter.add(loss.item())
# detach 一下更安全保险
confusion_matrix.add(score.detach(), target.detach())
if (ii + 1) % opt.print_freq == 0:
vis.plot('loss', loss_meter.value()[0])
print("loss:", loss_meter.value()[0])
# 进入debug模式
# if os.path.exists(opt.debug_file):
# import ipdb;
# ipdb.set_trace()
print("保存检查点...")
model.save()
cm_value = confusion_matrix.value()
vis.plot('train_accuracy', 100. * (cm_value[0][0] + cm_value[1][1]) / cm_value.sum())
# validate and visualize
val_cm, val_accuracy = val(model, val_dataloader)
vis.plot('val_accuracy', val_accuracy)
vis.log("\tepoch:{epoch},\tlr:{lr},\tloss:{loss},\ttrain_cm:{train_cm},\tval_cm:{val_cm}\t".format(
epoch=epoch, lr=lr, loss=loss_meter.value()[0], train_cm=str(confusion_matrix.value()),
val_cm=str(val_cm.value())))
# update learning rate
if loss_meter.value()[0] > previous_loss:
lr = lr * opt.lr_decay
# 第二种降低学习率的方法:不会有moment等信息的丢失
for param_group in optimizer.param_groups:
param_group['lr'] = lr
previous_loss = loss_meter.value()[0]
这里用到了PyTorchNet里面的一个工具: meter。meter提供了一些轻量级的工具,用于帮助用户快速统计训练过程中的一些指标。AverageValueMeter
能够计算所有数的平均值和标准差,这里用来统计一个epoch中损失的平均值。confusionmeter
用来统计分类问题中的分类情况,是一个比准确率更详细的统计指标。例如对于表格6-1,共有50张狗的图片,其中有35张被正确分类成了狗,还有15张被误判成猫;共有100张猫的图片,其中有91张被正确判为了猫,剩下9张被误判成狗。相比于准确率等统计信息,混淆矩阵更能体现分类的结果,尤其是在样本比例不均衡的情况下。
表6-1 混淆矩阵
样本 | 判为狗 | 判为猫 |
---|---|---|
实际是狗 | 35 | 15 |
实际是猫 | 9 | 91 |
PyTorchNet从TorchNet迁移而来,提供了很多有用的工具,但其目前开发和文档都还不是很完善,本书不做过多的讲解。
验证
验证相对来说比较简单,但要注意需将模型置于验证模式(model.eval()
),验证完成后还需要将其置回为训练模式(model.train()
),这两句代码会影响BatchNorm
和Dropout
等层的运行模式。验证模型准确率的代码如下。
@t.no_grad()
def val(model, dataloader):
"""
计算模型在验证集上的准确率等信息
"""
model.eval()
confusion_matrix = meter.ConfusionMeter(2)
for ii, (val_input, label) in tqdm(enumerate(dataloader)):
val_input = val_input.to(opt.device)
score = model(val_input)
confusion_matrix.add(score.detach().squeeze(), label.type(t.LongTensor))
model.train()
cm_value = confusion_matrix.value()
accuracy = 100. * (cm_value[0][0] + cm_value[1][1]) / (cm_value.sum())
return confusion_matrix, accuracy
测试
测试时,需要计算每个样本属于狗的概率,并将结果保存成csv文件。测试的代码与验证比较相似,但需要自己加载模型和数据。
@t.no_grad() # pytorch>=0.5
def test(**kwargs):
opt._parse(kwargs)
# configure model
model = getattr(models, opt.model)().eval()
if opt.load_model_path:
model.load(opt.load_model_path)
model.to(opt.device)
# data
train_data = DogCat(opt.test_data_root, test=True)
test_dataloader = DataLoader(train_data, batch_size=opt.batch_size, shuffle=False, num_workers=opt.num_workers)
results = []
for ii, (data, path) in tqdm(enumerate(test_dataloader)):
input = data.to(opt.device)
score = model(input)
probability = t.nn.functional.softmax(score, dim=1)[:, 0].detach().tolist()
batch_results = [(path_.item(), probability_) for path_, probability_ in zip(path, probability)]
results += batch_results
write_csv(results, opt.result_file)
return results
def write_csv(results, file_name):
import csv
with open(file_name, 'w') as f:
writer = csv.writer(f)
writer.writerow(['id', 'label'])
writer.writerows(results)
帮助函数
为了方便他人使用, 程序中还应当提供一个帮助函数,用于说明函数是如何使用。程序的命令行接口中有众多参数,如果手动用字符串表示不仅复杂,而且后期修改config文件时,还需要修改对应的帮助信息,十分不便。这里使用了Python标准库中的inspect方法,可以自动获取config的源代码。help的代码如下:
def help():
"""
打印帮助的信息: python file.py help
"""
print("""
usage : python file.py <function> [--args=value]
<function> := train | test | help
example:
python {0} train --env='env0701' --lr=0.01
python {0} test --dataset='path/to/dataset/root/'
python {0} help
avaiable args:""".format(__file__))
from inspect import getsource
source = (getsource(opt.__class__))
print(source)
当用户执行python main.py help
的时候,会打印如下帮助信息:
usage : python main.py <function> [--args=value,]
<function> := train | test | help
example:
python main.py train --env='env0701' --lr=0.01
python main.py test --dataset='path/to/dataset/'
python main.py help
avaiable args:
class DefaultConfig(object):
env = 'default' # visdom 环境
model = 'AlexNet' # 使用的模型
train_data_root = './data/train/' # 训练集存放路径
test_data_root = './data/test' # 测试集存放路径
load_model_path = 'checkpoints/model.pth' # 加载预训练的模型
batch_size = 128 # batch size
use_gpu = True # user GPU or not
num_workers = 4 # how many workers for loading data
print_freq = 20 # print info every N batch
debug_file = './debug/debug.txt'
result_file = 'result.csv' # 结果文件
max_epoch = 10
lr = 0.1 # initial learning rate
lr_decay = 0.95 # when val_loss increase, lr = lr*lr_decay
weight_decay = 1e-4 # 损失函数
6.1.9 使用
正如help
函数的打印信息所述,可以通过命令行参数指定变量名.下面是三个使用例子,fire会将包含-
的命令行参数自动转层下划线_
,也会将非数值的值转成字符串。所以--train-data-root=data/train
和--train_data_root='data/train'
是等价的。
# 训练模型
python main.py train
--train-data-root=data/train/
--lr=0.005
--batch-size=32
--model='ResNet34'
--max-epoch = 20
# 测试模型
python main.py test
--test-data-root=data/test
--load-model-path='checkpoints/resnet34_00:23:05.pth'
--batch-size=128
--model='ResNet34'
--num-workers=12
# 打印帮助信息
python main.py help
实验过程
本章程序及数据下载:百度网盘,提取码:aw26。
首先,在命令行cmd红启动visdom服务器:
python -m visdom.server
然后,训练模型:
python main.py train
训练结果如下:
从上述结果可以看出,模型的精度可以达到97%以上。你也可以手动更改模型,通过调节参数来进一步提升模型的准确率。
最后,测试模型:
python main.py test
第二列表示预测为狗的概率:
我们来看一下测试集图片:
可以看到,模型能够正确识别出很多狗和猫了,但是还存在很大的改进空间。
6.1.10 争议
以上的程序设计规范带有作者强烈的个人喜好,并不想作为一个标准,而是作为一个提议和一种参考。上述设计在很多地方还有待商榷,例如对于训练过程是否应该封装成一个trainer
对象,或者直接封装到BaiscModule
的train
方法之中。对命令行参数的处理也有不少值得讨论之处。因此不要将本文中的观点作为一个必须遵守的规范,而应该看作一个参考。
本章中的设计可能会引起不少争议,其中比较值得商榷的部分主要有以下两个方面:
- 命令行参数的设置。目前大多数程序都是使用Python标准库中的
argparse
来处理命令行参数,也有些使用比较轻量级的click
。这种处理相对来说对命令行的支持更完备,但根据作者的经验来看,这种做法不够直观,并且代码量相对来说也较多。比如argparse
,每次增加一个命令行参数,都必须写如下代码:
parser.add_argument('-save-interval', type=int, default=500, help='how many steps to wait before saving [default:500]')
在读者眼中,这种实现方式远不如一个专门的config.py
来的直观和易用。尤其是对于使用Jupyter notebook或IPython等交互式调试的用户来说,argparse
较难使用。
- 模型训练。有不少人喜欢将模型的训练过程集成于模型的定义之中,代码结构如下所示:
class MyModel(nn.Module):
def __init__(self,opt):
self.dataloader = Dataloader(opt)
self.optimizer = optim.Adam(self.parameters(),lr=0.001)
self.lr = opt.lr
self.model = make_model()
def forward(self,input):
pass
def train_(self):
# 训练模型
for epoch in range(opt.max_epoch)
for ii,data in enumerate(self.dataloader):
train_epoch()
model.save()
def train_epoch(self):
pass
抑或是专门设计一个Trainer
对象,形如:
"""
code simplified from:
https://github.com/pytorch/pytorch/blob/master/torch/utils/trainer/trainer.py
"""
import heapq
from torch.autograd import Variable
class Trainer(object):
def __init__(self, model=None, criterion=None, optimizer=None, dataset=None):
self.model = model
self.criterion = criterion
self.optimizer = optimizer
self.dataset = dataset
self.iterations = 0
def run(self, epochs=1):
for i in range(1, epochs + 1):
self.train()
def train(self):
for i, data in enumerate(self.dataset, self.iterations + 1):
batch_input, batch_target = data
self.call_plugins('batch', i, batch_input, batch_target)
input_var = Variable(batch_input)
target_var = Variable(batch_target)
plugin_data = [None, None]
def closure():
batch_output = self.model(input_var)
loss = self.criterion(batch_output, target_var)
loss.backward()
if plugin_data[0] is None:
plugin_data[0] = batch_output.data
plugin_data[1] = loss.data
return loss
self.optimizer.zero_grad()
self.optimizer.step(closure)
self.iterations += i
还有一些人喜欢模仿keras和scikit-learn的设计,设计一个fit
接口。对读者来说,这些处理方式很难说哪个更好或更差,找到最适合自己的方法才是最好的。
BasicModule
的封装,可多可少。训练过程中的很多操作都可以移到BasicModule
之中,比如get_optimizer
方法用来获取优化器,比如train_step
用来执行单歩训练。对于不同的模型,如果对应的优化器定义不一样,或者是训练方法不一样,可以复写这些函数自定义相应的方法,取决于自己的喜好和项目的实际需求。
6.2 PyTorch Debug指南
6.2.1 ipdb介绍
很多初学者用print或log调试程序,这在小规模的程序下很方便。但是更好的调试方法是一边运行一边检查里面的变量和方法。pdb是一个交互式的调试工具,集成于Python的标准库之中,由于其强大的功能,被广泛应用于Python环境中。pdb能让你根据需求跳转到任意的Python代码断点、查看任意变量、单步执行代码,甚至还能修改代码的值,而不必重启程序。ipdb是一个增强版的pdb,可通过pip install ipdb
安装。ipdb提供了调试模式下的代码补全,还具有更好的语法高亮和代码溯源,以及更好的内省功能,更关键的是,它与pdb接口完全兼容。
在本书第2章曾粗略地提到过ipdb的基本使用,本章将继续介绍如何结合PyTorch和ipdb进行调试。首先看一个例子,要是用ipdb,只需在想要进行调试的地方插入ipdb.set_trace()
,当代码运行到此处时,就会自动进入交互式调试模式。
假设有如下程序:
try:
import ipdb
except:
import pdb as ipdb
def sum(x):
r = 0
for ii in x:
r += ii
return r
def mul(x):
r = 1
for ii in x:
r *= ii
return r
ipdf.set_trace()
x = [1,2,3,4,5]
r = sum(x)
r = mul(x)
当程序运行至ipdb.set_trace(),会自动进入debug模式,在该模式中,我们可使用调试命令,如next或缩写n单步执行,也可查看Python变量,或是运行Python代码。如果Python变量名和调式命令冲突,需要在变量名前加"!",这样ipdb会执行对应的Python代码,而不是调试命令。下面举例说明ipdb的调试,这里重点讲解ipdb的两大功能。
- 查看:在函数调用堆栈中自由跳转,并查看函数的局部变量
- 修改:修改程序中的变量,并能以此影响程序的运行结果。
> e:\debug.py(19)<module>()
18 ipdb.set_trace()
---> 19 x = [1,2,3,4,5]
20 r = sum(x)
ipdb> l 1,21 # list 1,21的缩写,查看第1行到第21行的代码,光标所指的这一行尚未运行
1 try:
2 import ipdb
3 except:
4 import pdb as ipdb
5
6 def sum(x):
7 r = 0
8 for ii in x:
9 r += ii
10 return r
11
12 def mul(x):
13 r = 1
14 for ii in x:
15 r *= ii
16 return r
17
18 ipdb.set_trace()
---> 19 x = [1,2,3,4,5]
20 r = sum(x)
21 r = mul(x)
ipdb> n # next的缩写,执行下一步
> e:\debug.py(20)<module>()
19 x = [1,2,3,4,5]
---> 20 r = sum(x)
21 r = mul(x)
ipdb> s # step的缩写,进入sum函数内部
--Call--
> e:\debug.py(6)sum()
5
----> 6 def sum(x):
7 r = 0
ipdb> n # next单步执行
> e:\debug.py(7)sum()
6 def sum(x):
----> 7 r = 0
8 for ii in x:
ipdb> n # next单步执行
> e:\debug.py(8)sum()
7 r = 0
----> 8 for ii in x:
9 r += ii
ipdb> n # next单步执行
> e:\debug.py(9)sum()
8 for ii in x:
----> 9 r += ii
10 return r
ipdb> u # up的缩写,跳回到上一层的调用
> e:\debug.py(20)<module>()
19 x = [1,2,3,4,5]
---> 20 r = sum(x)
21 r = mul(x)
ipdb> d # down的缩写,跳到调用的下一层
> e:\debug.py(9)sum()
8 for ii in x:
----> 9 r += ii
10 return r
ipdb> !r # !r 查看变量r的值,该变量名与调试命令`r(eturn)`冲突
0
ipdb> r # return的缩写,继续运行直到函数返回
--Return--
15
> e:\debug.py(10)sum()
9 r += ii
---> 10 return r
11
ipdb> n # 下一步
> e:\debug.py(21)<module>()
19 x = [1,2,3,4,5]
20 r = sum(x)
---> 21 r = mul(x)
ipdb> x # 查看变量x的值
[1, 2, 3, 4, 5]
ipdb> x[0] = 10000 # 修改变量x的值
ipdb> b 13 # break的缩写,AI第13行设置断点
Breakpoint 1 at e:\debug.py:13
ipdb> c # continue的缩写,继续运行,直到遇到断点
> e:\debug.py(13)mul()
12 def mul(x):
1--> 13 r = 1
14 for ii in x:
ipdb> return # 返回的是修改后x的乘积
--Return--
1200000
> e:\debug.py(16)mul()
15 r *= ii
---> 16 return r
17
ipdb> q # quit的缩写,退出debug模式
Exiting Debugger.
关于ipdb的使用还有一些技巧:
- <tab>键能够自动补齐,补齐用法与IPython中的类似。
- j(ump) <lineno>能够跳过中间某些行代码的执行
- 可以直接在ipdb中修改变量的值
- h(elp)能够查看调试命令的用法,比如
h h
可以查看h(elp)命令的用法,h jump
能够查看j(ump)命令的用法。
6.2.2 在PyTorch中Debug
PyTorch作为一个动态图框架,与ipdb结合使用能为调试过程带来便捷。对TensorFlow等静态图框架来说,使用Python接口定义计算图,然后使用C++代码执行底层运算,在定义图的时候不进行任何计算,而在计算的时候又无法使用pdb进行调试,因为pdb调试只能调试Python代码,故调试一直是此类静态图框架的一个痛点。与TensorFlow不同,PyTorch可以在执行计算的同时定义计算图,这些计算定义过程是使用Python完成的。虽然底层的计算也是用C/C++完成的,但是我们能够查看Python定义部分的变量值,这就已经足够了。下面我们将举例说明。
- 如何AIPyTorch中查看神经网络各个层的输出。
- 如何在PyTorch中分析各个参数的梯度。
- 如何动态修改PyTorch的训练过程。
首先,运行第一节给出的“猫狗大战”程序:
python main.py train --debug-file='debug/debug.txt'
程序运行一段时间后,在debug目录下创建debug.txt标识文件,当程序检测到这个文件存在时,会自动进入debug模式。
99it [00:17, 6.07it/s]loss: 0.22854854568839075
119it [00:21, 5.79it/s]loss: 0.21267264398435753
139it [00:24, 5.99it/s]loss: 0.19839374726372108
> e:\workspace\python\pytorch\chapter6\main.py(80)train()
79 loss_meter.reset()
---> 80 confusion_matrix.reset()
81 for ii, (data, label) in tqdm(enumerate(train_dataloader)):
ipdb> break 88 # 在第88行设置断点,当程序运行到此处进入debug模式
Breakpoint 1 at e:\workspace\python\pytorch\chapter6\main.py:88
ipdb> # 打印所有参数及其梯度的标准差
for (name,p) in model.named_parameters(): \
print(name,p.data.std(),p.grad.data.std())
model.features.0.weight tensor(0.2615, device='cuda:0') tensor(0.3769, device='cuda:0')
model.features.0.bias tensor(0.4862, device='cuda:0') tensor(0.3368, device='cuda:0')
model.features.3.squeeze.weight tensor(0.2738, device='cuda:0') tensor(0.3023, device='cuda:0')
model.features.3.squeeze.bias tensor(0.5867, device='cuda:0') tensor(0.3753, device='cuda:0')
model.features.3.expand1x1.weight tensor(0.2168, device='cuda:0') tensor(0.2883, device='cuda:0')
model.features.3.expand1x1.bias tensor(0.2256, device='cuda:0') tensor(0.1147, device='cuda:0')
model.features.3.expand3x3.weight tensor(0.0935, device='cuda:0') tensor(0.1605, device='cuda:0')
model.features.3.expand3x3.bias tensor(0.1421, device='cuda:0') tensor(0.0583, device='cuda:0')
model.features.4.squeeze.weight tensor(0.1976, device='cuda:0') tensor(0.2137, device='cuda:0')
model.features.4.squeeze.bias tensor(0.4058, device='cuda:0') tensor(0.1798, device='cuda:0')
model.features.4.expand1x1.weight tensor(0.2144, device='cuda:0') tensor(0.4214, device='cuda:0')
model.features.4.expand1x1.bias tensor(0.4994, device='cuda:0') tensor(0.0958, device='cuda:0')
model.features.4.expand3x3.weight tensor(0.1063, device='cuda:0') tensor(0.2963, device='cuda:0')
model.features.4.expand3x3.bias tensor(0.0489, device='cuda:0') tensor(0.0719, device='cuda:0')
model.features.6.squeeze.weight tensor(0.1736, device='cuda:0') tensor(0.3544, device='cuda:0')
model.features.6.squeeze.bias tensor(0.2420, device='cuda:0') tensor(0.0896, device='cuda:0')
model.features.6.expand1x1.weight tensor(0.1211, device='cuda:0') tensor(0.2428, device='cuda:0')
model.features.6.expand1x1.bias tensor(0.0670, device='cuda:0') tensor(0.0162, device='cuda:0')
model.features.6.expand3x3.weight tensor(0.0593, device='cuda:0') tensor(0.1917, device='cuda:0')
model.features.6.expand3x3.bias tensor(0.0227, device='cuda:0') tensor(0.0160, device='cuda:0')
model.features.7.squeeze.weight tensor(0.1207, device='cuda:0') tensor(0.2179, device='cuda:0')
model.features.7.squeeze.bias tensor(0.1484, device='cuda:0') tensor(0.0381, device='cuda:0')
model.features.7.expand1x1.weight tensor(0.1235, device='cuda:0') tensor(0.2279, device='cuda:0')
model.features.7.expand1x1.bias tensor(0.0450, device='cuda:0') tensor(0.0100, device='cuda:0')
model.features.7.expand3x3.weight tensor(0.0609, device='cuda:0') tensor(0.1628, device='cuda:0')
model.features.7.expand3x3.bias tensor(0.0132, device='cuda:0') tensor(0.0079, device='cuda:0')
model.features.9.squeeze.weight tensor(0.1093, device='cuda:0') tensor(0.2459, device='cuda:0')
model.features.9.squeeze.bias tensor(0.0646, device='cuda:0') tensor(0.0135, device='cuda:0')
model.features.9.expand1x1.weight tensor(0.0840, device='cuda:0') tensor(0.1860, device='cuda:0')
model.features.9.expand1x1.bias tensor(0.0177, device='cuda:0') tensor(0.0033, device='cuda:0')
model.features.9.expand3x3.weight tensor(0.0476, device='cuda:0') tensor(0.1393, device='cuda:0')
model.features.9.expand3x3.bias tensor(0.0058, device='cuda:0') tensor(0.0030, device='cuda:0')
model.features.10.squeeze.weight tensor(0.0872, device='cuda:0') tensor(0.1676, device='cuda:0')
model.features.10.squeeze.bias tensor(0.0484, device='cuda:0') tensor(0.0088, device='cuda:0')
model.features.10.expand1x1.weight tensor(0.0859, device='cuda:0') tensor(0.2145, device='cuda:0')
model.features.10.expand1x1.bias tensor(0.0160, device='cuda:0') tensor(0.0025, device='cuda:0')
model.features.10.expand3x3.weight tensor(0.0456, device='cuda:0') tensor(0.1429, device='cuda:0')
model.features.10.expand3x3.bias tensor(0.0070, device='cuda:0') tensor(0.0021, device='cuda:0')
model.features.11.squeeze.weight tensor(0.0786, device='cuda:0') tensor(0.2003, device='cuda:0')
model.features.11.squeeze.bias tensor(0.0422, device='cuda:0') tensor(0.0069, device='cuda:0')
model.features.11.expand1x1.weight tensor(0.0690, device='cuda:0') tensor(0.1400, device='cuda:0')
model.features.11.expand1x1.bias tensor(0.0138, device='cuda:0') tensor(0.0022, device='cuda:0')
model.features.11.expand3x3.weight tensor(0.0366, device='cuda:0') tensor(0.1517, device='cuda:0')
model.features.11.expand3x3.bias tensor(0.0109, device='cuda:0') tensor(0.0023, device='cuda:0')
model.features.12.squeeze.weight tensor(0.0729, device='cuda:0') tensor(0.1736, device='cuda:0')
model.features.12.squeeze.bias tensor(0.0814, device='cuda:0') tensor(0.0084, device='cuda:0')
model.features.12.expand1x1.weight tensor(0.0977, device='cuda:0') tensor(0.1385, device='cuda:0')
model.features.12.expand1x1.bias tensor(0.0102, device='cuda:0') tensor(0.0032, device='cuda:0')
model.features.12.expand3x3.weight tensor(0.0365, device='cuda:0') tensor(0.1312, device='cuda:0')
model.features.12.expand3x3.bias tensor(0.0038, device='cuda:0') tensor(0.0026, device='cuda:0')
model.classifier.1.weight tensor(0.0285, device='cuda:0') tensor(0.0865, device='cuda:0')
model.classifier.1.bias tensor(0.0362, device='cuda:0') tensor(0.0192, device='cuda:0')
ipdb> opt.lr # 查看学习率
0.001
ipdb> opt.lr = 0.002 # 更改学习率
ipdb> for p in optimizer.param_groups: \
p['lr'] = opt.lr
ipdb> model.save() # 保存模型
'checkpoints/squeezenet_20191004212249.pth'
ipdb> c # 继续运行,直到第88行暂停
222it [16:38, 35.62s/it]> e:\workspace\python\pytorch\chapter6\main.py(88)train()
87 optimizer.zero_grad()
1--> 88 score = model(input)
89 loss = criterion(score, target)
ipdb> s # 进入model(input)内部,即model.__call__(input)
--Call--
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(537)__call__()
536
--> 537 def __call__(self, *input, **kwargs):
538 for hook in self._forward_pre_hooks.values():
ipdb> n # 下一步
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(538)__call__()
537 def __call__(self, *input, **kwargs):
--> 538 for hook in self._forward_pre_hooks.values():
539 result = hook(self, input)
ipdb> n # 下一步
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(544)__call__()
543 input = result
--> 544 if torch._C._get_tracing_state():
545 result = self._slow_forward(*input, **kwargs)
ipdb> n # 下一步
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(547)__call__()
546 else:
--> 547 result = self.forward(*input, **kwargs)
548 for hook in self._forward_hooks.values():
ipdb> s # 进入forward函数内容
--Call--
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\loss.py(914)forward()
913
--> 914 def forward(self, input, target):
915 return F.cross_entropy(input, target, weight=self.weight,
ipdb> input # 查看input变量值
tensor([[4.5005, 2.0725],
[3.5933, 7.8643],
[2.9086, 3.4209],
[2.7740, 4.4332],
[6.0164, 2.3033],
[5.2261, 3.2189],
[2.6529, 2.0749],
[6.3259, 2.2383],
[3.0629, 3.4832],
[2.7008, 8.2818],
[5.5684, 2.1567],
[3.0689, 6.1022],
[3.4848, 5.3831],
[1.7920, 5.7709],
[6.5032, 2.8080],
[2.3071, 5.2417],
[3.7474, 5.0263],
[4.3682, 3.6707],
[2.2196, 6.9298],
[5.2201, 2.3034],
[6.4315, 1.4970],
[3.4684, 4.0371],
[3.9620, 1.7629],
[1.7069, 7.8898],
[3.0462, 1.6505],
[2.4081, 6.4456],
[2.1932, 7.4614],
[2.3405, 2.7603],
[1.9478, 8.4156],
[2.7935, 7.8331],
[1.8898, 3.8836],
[3.3008, 1.6832]], device='cuda:0', grad_fn=<AsStridedBackward>)
ipdb> input.data.mean() # 查看input的均值和标准差
tensor(3.9630, device='cuda:0')
ipdb> input.data.std()
tensor(1.9513, device='cuda:0')
ipdb> u # 跳回上一层
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(547)__call__()
546 else:
--> 547 result = self.forward(*input, **kwargs)
548 for hook in self._forward_hooks.values():
ipdb> u # 跳回上一层
> e:\workspace\python\pytorch\chapter6\main.py(88)train()
87 optimizer.zero_grad()
1--> 88 score = model(input)
89 loss = criterion(score, target)
ipdb> clear # 清除所有断点
Clear all breaks? y
Deleted breakpoint 1 at e:\workspace\python\pytorch\chapter6\main.py:88
ipdb> c # 继续运行,记得先删除"debug/debug.txt",否则很快又会进入调试模式
59it [06:21, 5.75it/s]loss: 0.24856307208538073
76it [06:24, 5.91it/s]
当我们想要进入debug模式,修改程序中某些参数值或者想分析程序时,就可以通过创建debug标识文件,此时程序会进入调试模式,调试完成之后删除这个文件并在ipdb调试接口输入c继续运行程序。如果想退出程序,也可以使用这种方式,先创建debug标识文件,然后输入quit在退出debug的同时退出程序。这种退出程序的方式,与使用Ctrl+C的方式相比更安全,因为这能保证数据加载的多进程程序也能正确地退出,并释放内存、显存等资源。
PyTorch和ipdb集合能完成很多其他框架所不能完成或很难完成的功能。根据笔者日常使用的总结,主要有以下几个部分:
(1)通过debug暂停程序。当程序进入debug模式后,将不再执行PCU和GPU运算,但是内存和显存及相应的堆栈空间不会释放。
(2)通过debug分析程序,查看每个层的输出,查看网络的参数情况。通过u(p)、d(own)、s(tep)等命令,能够进入指定的代码,通过n(ext)可以单步执行,从而看到每一层的运算结果,便于分析网络的数值分布等信息。
(3)作为动态图框架,PyTorch拥有Python动态语言解释执行的优点,我们能够在运行程序时,用过ipdb修改某些变量的值或属性,这些修改能够立即生效。例如可以在训练开始不久根据损失函数调整学习率,不必重启程序。
(4)如果在IPython中通过%run魔法方法运行程序,那么在程序异常退出时,可以使用%debug命令,直接进入debug模式,通过u(p)和d(own)跳到报错的地方,查看对应的变量,找出原因后修改相应的代码即可。有时我们的模式训练了好几个小时,却在将要保存模式之前,因为一个小小的拼写错误异常退出。此时,如果修改错误再重新运行程序又要花费好几个小时,太浪费时间。因此最好的方法就是看利用%debug进入调试模式,在调试模式中直接运行model.save()保存模型。在IPython中,%pdb魔术方法能够使得程序出现问题后,不用手动输入%debug而自动进入debug模式,建议使用。
PyTorch调用CuDNN报错时,报错信息诸如CUDNN_STATUS_BAD_PARAM,从这些报错内容很难得到有用的帮助信息,最后先利用PCU运行代码,此时一般会得到相对友好的报错信息,例如在ipdb中执行model.cpu()(input.cpu()),PyTorch底层的TH库会给出相对比较详细的信息。
常见的错误主要有以下几种:
- 类型不匹配问题。例如CrossEntropyLoss的输入target应该是一个LongTensor,而很多人输入FloatTensor。
- 部分数据忘记从CPU转移到GPU。例如,当model存放于GPU时,输入input也需要转移到GPU才能输入到model中。还有可能就是把多个model存放于一个list对象,而在执行model.cuda()时,这个list中的对象是不会被转移到CUDA上的,正确的用法是用ModuleList代替。
- Tensor形状不匹配。此类问题一般是输入数据形状不对,或是网络结构设计有问题,一般通过u(p)跳到指定代码,查看输入和模型参数的形状即可得知。
此外,可能还会经常遇到程序正常运行、没有报错,但是模型无法收敛的问题。例如对于二分类问题,交叉熵损失一直徘徊在0.69附近(ln2),或者是数值出现溢出等问题,此时可以进入debug模式,用单步执行查看,每一层输出的均值和方差,观察从哪一层的输出开始出现数值异常。还要查看每个参数梯度的均值和方差,查看是否出现梯度消失或者梯度爆炸等问题。一般来说,通过再激活函数之前增加BatchNorm层、合理的参数初始化、使用Adam优化器、学习率设为0.001,基本就能确保模型在一定程度收敛。
本章带领读者从头实现了一个Kaggle上的经典竞赛,重点讲解了如何合理地组合安排程序,同时介绍了一些在PyTorch中调试的技巧。