通过Image J计算灰度值

ImageJ是一款基于 java的,由 National Institutes of Health(NIH)开发的一款功能强大的图像处理软件,在科研中应用极为广泛。

ImageJ在科研领域相当重要,2021年被Nature评为十大影响科学的代码。如果你在实验中会接触到图像,ImageJ这个软件应该是必备的科研工具。

安装
官方下载网址https://imagej.nih.gov/ij/download.html
选择适合系统的版本下载,下载好即可运行。

下载

使用
1.打开软件,通过 File→Open 打开要分析的胶图,或直接拖拽胶图至软件即可识别;
2.如果胶图为黑底白带,则需要反色:点击Edit→Invert,如下图所示,变为白底黑带;
Invert

白底黑带

3.将胶图通过Image→Type→8-bit将图片转为8位的灰度图,即从黑到白有256(0~255)种灰色的黑白图片;
8-bit

4.将胶图的灰色背景去掉:点击PROCESS→Subtract Background→ Rolling ball radius: 50.0 pixels, 勾选Light Background;
Subtract Background

Light Background

5.用矩形选框工具(工具栏第一个)框选同一行的所有条带,如下所示;


6.完成框选后,按Ctrl+1,紧接着按Ctrl+3,得到峰形图;
峰形图

7.使用直线工具,将所有6个小峰图封闭起来;


8.选择魔法棒工具,依次点击封闭后的各个小峰,即可得到灰度值。



灰度值
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