R语言基础入门(10) 横空出世的across函数

本节继续来介绍tidyverse中的重要函数across,需要更新至 dplyr-1-0-0

across()它可以轻松地对多列执行相同的操作

across() 有两个主要参数:

  • 第一个参数.cols选择要操作的列
  • 第二个参数.fns是要应用于每一列的一个函数或函数列表
创建数据
gdf <- tibble(g = c(1,1,2,3),v1 = 10:13,v2 = 20:23,v3=1:4)
gdf
      g    v1    v2    v3
  <dbl> <int> <int> <int>
1     1    10    20     1
2     1    11    21     2
3     2    12    22     3
4     3    13    23     4

给每一列加1

gdf %>% mutate(across(v1:v3, ~ .x +1))
      g    v1    v2    v3
  <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1     1    11    21     2
2     1    12    22     3
3     2    13    23     4
4     3    14    24     5

前两列四舍五入

iris %>%
  as_tibble() %>%
  mutate(across(c(1,2),round))
   Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
          <dbl>       <dbl>        <dbl>       <dbl> <fct>  
 1            5           4          1.4         0.2 setosa 
 2            5           3          1.4         0.2 setosa 
 3            5           3          1.3         0.2 setosa 

还有如下2种写法

iris %>%
  as_tibble() %>%
  mutate(across(1:Sepal.Width, round))
iris %>%
  as_tibble() %>%
  mutate(across(where(is.double) & !c(Petal.Length, Petal.Width), round))

按列求均值

iris %>% summarize(across(is.numeric,mean))

按行求和

iris %>% as_tibble() %>% 
  rowwise() %>%
  mutate(mean = sum(across(where(is.numeric))))

分组求均值

iris %>%
  group_by(Species) %>%
  summarise(across(starts_with("Sepal"), ~ mean(.x, na.rm = TRUE)))
  Species    Sepal.Length Sepal.Width
  <fct>             <dbl>       <dbl>
1 setosa             5.01        3.43
2 versicolor         5.94        2.77
3 virginica          6.59        2.97

分组求和

iris %>%
  group_by(Species) %>%
  summarise(across(starts_with("Sepal"), ~ sum(.x, na.rm=TRUE)))
  Species    Sepal.Length Sepal.Width
  <fct>             <dbl>       <dbl>
1 setosa             250.        171.
2 versicolor         297.        138.
3 virginica          329.        149.
iris %>%
  group_by(Species) %>%
  summarise(across(starts_with("Sepal"), list(mean = mean, sd = sd)))
  Species    Sepal.Length_mean Sepal.Length_sd Sepal.Width_mean Sepal.Width_sd
  <fct>                  <dbl>           <dbl>            <dbl>          <dbl>
1 setosa                  5.01           0.352             3.43          0.379
2 versicolor              5.94           0.516             2.77          0.314
3 virginica               6.59           0.636             2.97          0.322

使用.name参数控制输出名

iris %>%
  group_by(Species) %>%
  summarise(across(starts_with("Sepal"), mean, .names = "mean_{.col}"))
  Species    mean_Sepal.Length mean_Sepal.Width
  <fct>                  <dbl>            <dbl>
1 setosa                  5.01             3.43
2 versicolor              5.94             2.77
3 virginica               6.59             2.97

筛选没有缺失值的行

starwars %>% filter(across(everything(), ~ !is.na(.x)))

使用时mutate(),所有转换across()都将立即应用

df <- tibble(x = 2, y = 4, z = 8)
df %>% mutate(across(everything(), ~ .x / y))
      x     y     z
  <dbl> <dbl> <dbl>
1   0.5     1     2

统计字符长度

starwars %>% 
  summarise(across(where(is.character), ~ length(unique(.x))))
   name hair_color skin_color eye_color   sex gender homeworld species
  <int>      <int>      <int>     <int> <int>  <int>     <int>   <int>
1    87         13         31        15     5      3        49      38

统计列最小/最大值

min_max <- list(
  min = ~min(.x, na.rm = TRUE), 
  max = ~max(.x, na.rm = TRUE)
)
iris %>% summarise(across(where(is.numeric),min_max))
  Sepal.Length_min Sepal.Length_max Sepal.Width_min Sepal.Width_max Petal.Length_min Petal.Length_max Petal.Width_min Petal.Width_max
1              4.3              7.9               2             4.4                1              6.9             0.1             2.5

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