WB实验前不同蛋白处理

1️⃣ 核蛋白(Nuclear proteins)

如:NF-κB p65、p-p65、GATA4、p53、Histone 家族

特点: 量少、易降解、磷酸化敏感

WB重点:

❗必须严格使用 核提取(NE-PER 或高盐法)

PMSF、蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂

转膜不要太久:0.2 μm PVDF 优先

封闭建议 低背景快速封闭液(10 min) 可避免核蛋白的高背景问题

2️⃣ 细胞膜蛋白(Membrane proteins)

如:EGFR、Na⁺/K⁺ ATPase、受体类

特点: 疏水性强、难溶

WB重点:

裂解缓慢 ⇒ 需要 RIPA + 1% Triton X-100 或 SDS 缓冲

电泳容易跑得慢、拖尾

转膜最好 延长时间或提高电流

❗封闭要用低背景型,普通奶粉容易导致膜蛋白背景高

3️⃣ 细胞质蛋白(Cytosolic proteins)

如:GAPDH、β-actin、Tubulin

特点: 稳定、量大、好跑

WB重点:

基本不挑体系

内参常用选择

标准 RIPA 足够

你新体系的“干净背景 + 条带锐利”在细胞质蛋白上效果会特别明显。

4️⃣ 线粒体蛋白(Mitochondrial proteins)

如 COX IV、TOM20

特点: 多跨膜结构

WB重点:

裂解液需比较“暴力”:RIPA + SDS

转膜需更强电压或湿转

条带常偏粗 ⇒ 尽量用 12–15% 胶

5️⃣ 分泌蛋白(Secreted proteins)

如 IL-6、MMP9、激素类

特点: 在细胞外,浓度很低

WB重点:

需要收集上清,浓缩(10K/30K 过滤柱)

条带可能弱 ⇒ 一抗浓度需要高一些

胶浓度 10% 或以下可避免低分子量跑过头

6️⃣ 磷酸化蛋白(p-protein)

如 p-p38、p-ERK、p-AKT

特点: 极不稳定

WB重点:

❗采样必须加 磷酸酶抑制剂

全程低温

电泳 不宜过热 → 你之前问的“发热”问题就和它关系最大

封闭一定要 10 min 快速封闭液(奶粉含磷酸会干扰)

7️⃣ 高分子量蛋白(>200 kDa)

如:凝血因子、某些受体

特点: 不好迁移

WB重点:

建议湿转 > 2 h

低百分比胶(6–8%)

一抗孵育时间要长

8️⃣ 低分子量蛋白(<15 kDa)

如:小肽激酶、某些核小蛋白

特点: 容易跑出胶

WB重点:

15–20% 胶

注意转膜用 0.2 μm,时间不能太久

膜蛋白快速封闭液也能防止背景遮盖

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