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zmCCT9增强了玉米的向高纬度的适应性啊

1摘要部分

起初，大刍草进化而来的玉米是短日照，在短日条件下开花，长日照条件下花期推迟甚至不开花。通过定位克隆和关联定位，将一个花期数量性状位点确定位于CCT转录因子(ZmCCT9)上游57 kb的（Harbinger-like）的转座元件。Harbinger-like元件顺式抑制ZmCCT9表达，促进长日照开花。CRISPR/Cas9敲除ZmCCT9会导致长时间开花提前。ZmCCT9受昼夜调控，负向调控成花原基因ZCN8的表达，从而导致在长日照条件下开花时间较晚。 群体遗传学分析表明，Zmcct9上的harbinger样转座子插入和另一个CCT平行序列ZmCCT10上的caca样转座子插入在驯化后依次出现，并且是玉米适应高纬度的选择目标。我们的发现有助于解释在前哥伦布时代，具有丰富转座子活性的动态玉米基因组如何使玉米适应超过90°的纬度

总结CCT9和10上面的转座子插入降低玉米对于短日照的敏感性

F1-1锁定区间

利用866个大群体的玉米-大刍草BC 2 s3重组自交系(RILs)，在长日照条件下进行了开花天数的QTL定位(27)。然后精细定位，确定在2.4kb的位置，同时这2.4kb为非编码区。

分离出NIL系

在自然长日照条件下的田间测试表明，NIL(玉米)比NIL(大刍草)早大约4天开花(图1 d - f)，同时植株高度和叶数也较低(SI附录，图S2)。然而，短日照条件下，这些差异不显著。表明qDTA9受光周期调控。

关联分析找到TE

CCT9和CCT10分别在chr9和chr10，所以命名9-10.关联分析确定变异位点TE（qtl）与TE24k下游ZmCCT9基因。

这个部分就是常规验证CCT9是否作用花期

表达情况分析

zmct9是受昼夜调控的，玉米等位基因的光周期敏感性比大刍草等位基因低得多，这可能是由于qDTA9 2.4 kb致病区域的Harbinger-like元件的抑制作用

TE抑制表达

进化分析

首先，发现73个大刍草祖先群体中都没有这个TE，然后分别看了有TE的玉米自交系，无TE的玉米自交系，以及大刍草三个大群中核苷酸多态性的比例，发现大刍草中多态性最多，无TE群众多态性其次，而又TE玉米群众多态性最低。

后面基本都是一样的东西