生理性自闭症，主要是指其个体生理方面，在通过医学检测，而各项生理指标处于正常状态中，出现自闭症的行为特征。这主要是发育迟缓加上环境不适合，所诱发的自闭症症状。而发育迟缓方面，又涉及到遗传和饮食两大主要因素。同时也不能完全排除在医学上尚难检查和发现的生理性疾病。
除此之外。还有一项涉及先天智力因素，既单纯的智力低下，因其父母期待性或者盲目性，导致环境冲突而诱发自闭症。这方面明显涉及国土文化与教育文化。
单纯的智力低下，既可单独导致后天自闭症，也可以和生理性自闭症，两者同时交叉存在于此消彼长的个体儿童中。而这种交叉现象，目前最好的方法，只能从心理学和五行文化中，通过情绪行为验证，在辩证中获得其正确结果。这种现象从本质上来说，不管是单独存在的自闭症，还是以交叉形式存在的自闭症，同样也可以归纳为生理性自闭症。
生理性自闭症个体内因：
生理性自闭症主要由发育迟缓为主要诱因。其整体内因可以归纳为主要四个因素。
1.生理发育迟缓
2.心理情绪感知发育迟缓
3.认知与智力发育迟缓
4.身心协调发育迟缓
四个因素，既可单独存在，也可以两个或者三个因素同时存在，同样四个因素也可以同时存在于个体。四个因素中，同时存在的因素越多，其整体状态就会越平衡，也就不容易受到环境的影响而越有利于康复。
反过来说同样道理，四个因素同时存在越少，其个体平衡度就会越低，导致的冲突就会越严重，对外环境就会越敏感或者迟钝等等。乃至于由内在的个体五官触觉，由外在的声缘色相都会出现平衡失调，而诱发更多情绪行为感知以及智力问题。
