染色质可达性的分析可以揭示转录调控序列，但初级组织的异质性对在特定细胞类型中精确绘制染色质景观提出了重大挑战。在这里，我们报道了单核ATAC-seq，一种组合bar编码辅助单细胞测定转位酶可达染色质的方法，该方法被优化用于快速冷冻初级组织样本。我们将这项技术应用于老鼠前脑的八个发育阶段。通过分析超过15000个细胞核，我们确定了20个不同的细胞群对应的主要神经元和非神经元细胞类型。我们进一步定义细胞类型特异性的转录调控序列，推断潜在的主转录调控因子，并描述前脑细胞组成的发育变化。我们的结果提供了对小鼠前脑发育的分子和细胞动力学的洞察，并建立了广泛适用于其他异质组织的技术和分析框架。
