R相关性分析

1.理论部分

Pearson(默认)

最常规的线性分析。计算公式

适用条件

  • 变量线性关系、连续
  • 两个变量总体符合正态分布
  • 标准差不能为0
  • 异常值较敏感

Spearman(秩相关系数)

其值与两个相关变量的具体值无关,而仅仅与其值之间的大小关系有关。

(1,10,100,101)->(1,2,3,4)
(21,10,15,13)->(4,1,3,2)

再利用Pearson公式对转换后的(1,2,3,4,)计算相关性.
适用条件:

  1. 等级变量之间的相关系数
  2. 对处理异常比较好,因为最大值最小值的具体数值对整体数据影响较大,但是排序通常不会有明显变化

Kendall(和谐系数)

其值与两个相关变量的具体值无关,而仅仅与其值之间的大小关系有关。
对于X,Y的两对观察值Xi,Yi和Xj,Yj,如果Xi<Yi并且Xj<Yj,或者Xi>Yi并且Xj>Yj,则称这两对观察值是和谐的,否则就是不和谐的。偏向一致性评价
计算公式

显著性检测

进行相关性检测时数据量越大,相关系数越小,所以相关系数和显著性应该同时说明。
计算公式:

查表确定显著性水平α
以上理论知识相关参考:https://www.cnblogs.com/kemaswill/archive/2012/11/01/2749842.html

2.R实现部分

require(xlsx);
require(psych);
require(corrplot);
require(corrgram);
require(PerformanceAnalytics);

data<-"E:\\corr\\CorrM_1000.xlsx";
M1<-read.xlsx(data,1,encoding='UTF-8');

##计算相关系数,并绘制相关系数矩阵
##corr<-cor(M1,method="pearson");

##无法生成散点图
##corrplot.mixed(corr,upper="circle",lower="shade",addCoef.col = "black");

##计算显著性水平
##corr.test(M1, adjust = "none", use = "complete")


##有上下两个部分,但是无法生成相关系数的圆圈
##corrgram(M1,lower.panel=panel.fill,upper.panel=panel.pts,text.panel=panel.txt)


##也无法生成相关系数的圆圈
chart.Correlation(M1, histogram=TRUE, pch=30);

效果图

其中,1个点代表90%的置信度,1颗星代表95%的置信度,2颗代表99%的置信度,3颗星代表99.9%的置信度

一直想绘制散点图在下(或下),相关性圆圈在上(或下),并标注出相关性大小和显著性,但一直没有成功。知道的评论区教教我呀~~~
另,panel所有函数:

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 213,014评论 6 492
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 90,796评论 3 386
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 158,484评论 0 348
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 56,830评论 1 285
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 65,946评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,114评论 1 292
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,182评论 3 412
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 37,927评论 0 268
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,369评论 1 303
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 36,678评论 2 327
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 38,832评论 1 341
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,533评论 4 335
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,166评论 3 317
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 30,885评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,128评论 1 267
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 46,659评论 2 362
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 43,738评论 2 351