2021-03-01生信技能树-生信入门D1

生信技能树2021生信入门线上课笔记,需要结合课程讲解服用

R:用函数处理数据,函数存在于R包中

用户发送命令,R执行并返回结果

交互式会话session

1.新建project成功的标志,看Rstudio右上角出现输入project的名称

一切围绕project,一个项目一个project

1 project.png

2.新建脚本(代码组织成的文件)

把正确的代码保存成脚本方便以后调取

2 脚本.png
  1. run Windows快捷键control+enter

  2. 井号#后面写注释,不会被运行

5.脚本的保存.R结尾,保存到R project的文件夹里(工作目录)

3 工作目录.png
x1 = read.csv("x.csv")  #读取放在工作目录下的文件

head(x1)

pdf("x.pdf")

plot(x1$len,col = factor(x1$dose))

title("Have a try")   #画的图保存于PDF,工作目录

dev.off()    #关闭

write.table(x1,"x.txt")

7.error:检查命令,环境,修正后重新运行

Warning:可以忽略,仅是温馨提示,后面有报错或者意外结果再检查

出现大于号,表示已经运行完成;没有大于号表示正在运行,按esc或者红色键终止

出现+,表示命令不完整,补全命令或者esc退出

出现提示信息,没有error就可以忽略,有问题就回答

8.数据类型

数值型

字符型:“” ’’ 双/单引号

逻辑型:TRUE,FALSE,NA(缺失,不是不存在)

【Null:没有,不存在】

判断数据类型的函数:class()

9.R语言严格区分大小写

问号在哪里,哪里的字符是不识别的,注意中英文字符

输入函数前几个字母,用上下键选择,之后用tab或者enter选择,可输入带括号的函数

光标放在大于号后面,用上下键选择之前运行过的代码

10.Markdown 写笔记 简书里面有教程

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 219,366评论 6 508
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 93,521评论 3 395
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 165,689评论 0 356
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,925评论 1 295
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,942评论 6 392
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,727评论 1 305
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,447评论 3 420
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 39,349评论 0 276
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,820评论 1 317
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,990评论 3 337
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 40,127评论 1 351
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,812评论 5 346
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,471评论 3 331
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 32,017评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 33,142评论 1 272
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 48,388评论 3 373
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 45,066评论 2 355

推荐阅读更多精彩内容