工具选择
UKB,FinnGen
何为因果关系
寻找合适的变量
工具变量的选择
强相关,阈值
独立性,不存在任何关联
排他性,不存在任何相关性
寻找合适的工具变量 遗传变异 SNP,GWAS
OpenGWAS,GWASCatalog,UK BioBank
已发表的文献,使用的数据
P值,5E-8,可以用1E-5,,看F值阈值10,大于10.
phenoscanner,,第二章最后一章有点难啊
步骤以及涉及到的统计方法是什么?
暴露因素:生物标志物或生活方式
孟德尔随机化就是利用基因的随机性来帮助我们理解某些因素(比如饮食或者锻炼)是否真能导致某些结果(比如疾病或者身体状况)
比如吃糖与肥胖之间的关系,吃糖是暴露因素是否会导致肥胖(结局)。
我们引入了一个基因(工具变量),这个基因会让人喜欢吃糖),随后我们看看有这个基因的人是否更容易肥胖。 因为基因是随机分配的,去GWAS里面去分析,全基因组关联分析。
计算暴露变量对结果变量的因果效应,需要涉及到一些模型和方法
5种方法
二阶段最小二乘法(2SLS),逆方差加权法(IVW),加权中位数法(Weighted Median),模型选择法(MR-Egger)),简单模式(Simple Mode)