dotPlotly

1.目的

使用 dotPlotly 可视化 minimap2 或者 mummer 得到的序列比对结果。

2.安装

dotPlotly 其实就是个R程序,运行依赖3个R包。这里就直接搞了个conda环境,把对应的R包装上而已。
dotPlotly 程序从github下就好。

conda create -n dotPlotly r-base
conda activate dotPlotly
conda install r-optparse
conda install r-ggplot2
conda install r-plotly
git clone https://github.com/piyixing/dotPlotly.git

3.使用

conda activate dotPlotly
mummerCoordsDotPlotly.R -h
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容