古巴导弹危机，美国骑虎难下，不先动手，就有可能被古巴的导弹攻击，如果先动手，可能会惹毛苏联。后来他们想了一个稳妥的办法，海军180艘军舰，开到了加勒比海域，飞机和装甲师也全面行动，做好战斗准备。接着美国外交官，全面出击，向全世界说明情况，这个事一公开，全世界哗然，肯尼迪顺水推舟，对全世界发表演讲。说我们正在遭受到苏联人的核威胁，美国已经将该区域封锁，任何古巴发射的导弹，都将被视为苏联的入侵，美国必将给予核反击。
事情暴露后，赫鲁晓夫有点猝不及防，莫斯科方面完全没有动静。美国的封锁隔离任务，已经全面开始，苏联向古巴的航道被全面切断。但古巴的导弹基地依旧在如火如荼的建设当中。美国也发出最后的条件，必须对方拆除导弹基地，否则没得谈。
后来，赫鲁晓夫承认了在古巴设计了导弹，现在他提议，苏联拆除导弹，美国也必须承认，不再入侵古巴。对于这个提议，肯尼迪是可以接受的，不过后来赫鲁晓夫又又加了一条，让美国拆除在土耳其的导弹基地。这个美国就不能接受了，因为土耳其的导弹基地，表明了美国对于土耳其的态度，所以，绝不能拿来做苏联的交换条件。否则会失了人心。这时候更坏的消息传来，美国侦查飞机，在古巴上空被击毁，这意味着古巴导弹基地已经准备就绪。所以大战一触即发。
肯尼迪决定，用赫鲁晓夫最初的提议回复苏联，并向全世界宣布，他已经答应了苏联撤出导弹，不打古巴的建议。然后同时做好空袭准备。第二天如果赫鲁晓夫拒绝，第三次世界大战就会打响。当时美国政府很多高官，已经开始考虑写遗书料理后事的问题了。
不过苏联在最后时刻，还是怂了。而美国也马上下令，停止一切武力展示，肯尼迪为了不激怒赫鲁晓夫，通知全国，不发任何关于美国胜利的言论。古巴导弹危机，就这样重新峰回路转。这次危机可把美苏双方，都吓的够呛。
1963年，黑人民权运动还在持续，500名黑人在伯明翰被逮捕，肯尼迪又一次调动军队，武力平息暴动，然后再让双方谈判。当时很多州长也在支持种族隔离，这已经成了一个政治主张，打着种族牌的州长们，更容易获得白人的支持。为此，这些州长，不惜与肯尼迪直接对抗。
亚拉巴马州的州长华莱士，为了拒绝两名黑人学生入学，甚至直接带着警察，堵在学校门口，阻止这两名学生进入学校。民权运动还远没有结束，南方的一些极端分子，开始了暗杀活动，随后20多万名权运动者，在华盛顿聚集。这次游行还留下了一段经典的语录，就是马丁路德金在林肯纪念堂前的那段演讲，我有一个梦想。
当时肯尼迪处理种族问题的时候，引发了很多人的不满，有的国会议员，虽然表面支持，但是他们也把自己的孩子送进了私立学校，在南方尤其如此，伯明翰市几乎没白人会选择肯尼迪。
这段时间，美苏关系全面改善，白宫和克里姆林宫之间，设立了热线电话。另一方面，在1963年10月，中苏关系破裂，赫鲁晓夫则借口，他不赞同中国不惜牺牲几百万人生命，也要在核试验上与西方世界对决。这等于，苏联就跟美国站在了一起，而把中国彻底孤立了。美苏之间也开始有了些许的经贸往来。
肯尼迪的目标就是发展经济，在对待越南的态度上，美国也分成了鹰派和鸽派，支持美国参与越战的都是一些将领，军官，而不支持的就有他的哥哥当时的司法部长，罗伯特肯尼迪。而越南的矛盾已经不可调和，1963年5月，战争就爆发了。佛教徒的聚会，后来和尚竟然集体自焚。美国人则给吴庭艳压力，让他尽快平息。肯尼迪还是在尽可能的维持和平。
后来，吴庭艳就背弃了对肯尼迪的承诺，逮捕了那些和尚，这就令吴庭艳政府中很多人的不满，已经有人憋着造反了，肯尼迪当时并不想无条件支持吴庭艳政府一个腐败的政府，他还是坚信只有得到人民的支持，战争才会胜利。他也向吴庭艳政府喊话，可以提供帮助，但是你自己必须想办法得到越南人民的支持。10月初，美国停发了越南的工资，这就让吴庭艳愤怒的指责肯尼迪。还派人到美国来做演讲，在哈佛大学演讲的时候，遭到了学生的示威。
随后吴庭艳更愤怒了，他们扬言要跟河内结盟，把美国人赶出越南。他甚至开始攻击学校，这一下也把美国人激怒了，马上告诉越南政府的反对派，只要他们发动政变，美国人就会给予支持。
11月1日，越南海军陆战队果然发动政变，开始攻击吴庭艳政府所在的嘉隆宫，后来吴庭艳兄弟被抓，然后被乱枪打死。越南的问题似乎告一段落。这个地方只要不打仗，全世界都可以暂时消停一会了。
那一年柯达公司，推出了傻瓜相机，宝丽来公司研制出了彩色胶卷，当时美国社会越来越开放，很多女孩主动把自己的裸照寄给花花公子杂志，这也让校园性行为越来越无拘无束。
在1963年美国发生了人口向西移动的现象，而婴儿潮的出现，让美国人年龄中位数下降到了29.5岁。工会已经大势已去，蓝领工人数量减少，白领数量增加了。40%的美国家庭，年收入超过7000美元。这个时代，美国几乎消灭了无产阶级。
