索引四 LSM树

一 背景

本来想写点B+树的,不过B+树因为用在Mysql等关系型数据库中,大家都比较了解了,而LSM树这种索引设计思路主要用在NoSql中,如果没有接触过NoSQL数据库的朋友可能了解不多,就开一篇介绍下,参考了不少的文章和资料。

LSM树是Log Structured Merge Trees的简称(这里面的日志,不一定是指我们程序的日志,也是指一类以时间为其中维度的大批量的树)。在NoSQL数据库中有广泛的应用(比如LevelDB和HBASE等)。严格来讲并不是一种索引结构,是一种索引设计的整体架构性的东西。B+树作为关系型数据库常用的索引存储结构,本身挺优秀的,支持范围查询,随机访问,增删改查都支持的不错,只是如果在修改的时候,B+树的聚簇索引数据是存在叶子节点的,需要磁盘的随机读写,随机写的性能不够好。磁盘的随机读写的性能不好,顺序读写的性能可以达到和内存一个数量级别,对此的优化很容易想到采用批量顺序写替代磁盘的随机写。

LSM树适合的场景是写入的量很大,查询的量比较小,而且查询查询近期的数据,老的数据一般很少查询的场景,比较适合用LSM树。

二 LSM树的关键思想

Log Structured 采用日志追加的方式,而不是采用随机写,追加采用顺序写,所以性能好。另一个重要的思想是Merge Trees , 数据写入的时候,先写入到内存的树中,可以是红黑树,也可能是B+树,有的采用跳表的内存数据结构。
当内存中的树大小达到一定规模后,将内存中的树和磁盘中的树进行合并,这就是合并树的来源。数据开始写入到内存的时候,如果突然断电,或者系统异常,会导致数据丢失,为了防止数据丢失,采用WAL(Write Ahead Log 预写日志技术)将数据第一时间写入到磁盘文件中,由于是顺序写,所以性能上不用担心。在发生异常的时候,可以通过WAL文件进行数据恢复。

RocksDB中的LSM组成

如上图所示,LSM树,整体由内存部分数据结构和磁盘上的两类文件组成。
内存中的数据结构为memtable和immutable Memtable两部分组成,前一个可读可写,后一个是只读的,它们两是一样的数据结构。immutable Memtable 由于是只读的,可以在刷入到磁盘的时候不用加锁,提升性能。那么数据是如何读写的那?

写数据

  1. 写请求来之后,写入到WAL中和内存的memtable中,memtable可以是红黑树或跳表等。
  2. 如果memtable满了,就新申请内存构建一个新的memtable,且将原来的memtable转为只读的immutable memtable,适当时机刷到磁盘中,保存为一个SStable文件。
  3. 刷新到磁盘之后,就可以对WAL日志进行截断,这样防止WAL日志的无限扩大的问题。
  4. immutable memtable 保存到磁盘中,如果直接和磁盘上的文件进行合并,因为内存中的数据少,磁盘中的很大,合并的数据很少,却占用了大量的IO磁盘,这肯定不行。所以像LevelDB采用延迟合并的方式,每层满了之后,都会和下一层进行滚动合并。

读数据

  1. 读数据的时候,先从内存中的memtable中读取。
  2. 如果没有,则到immutable memtable中读取。
  3. 如果仍然未查询到数据,则到缓存中读取,缓存里面包括数据缓存和索引缓存。
  4. 如果仍然没有找到,则从Level 0层开始查找,由于Level 0层的SSTable没有合并,所以数据是有重合的,所以每个SSTable都需要查找,Level 0层的只有4MB(level DB)中,所以也比较快。
  5. 如果Level 0 层,没有找到数据,则下沉到下一层Level 1层继续查找,一层以及以后层次SSTABLE文件是不重合的,所以可以通过快速定位到SSTable文件中,进行查找,找到了或所有的层都查找完毕后返回。

三 SSTable

SSTableSorted String Table ,听着蛮高大上,其实就是排序的有序键值对集合,是存储在文件中的结构。
我们保存哈希表为磁盘文件中,为了提升查询速度,一般还保存一个索引文件,保存key和offset的位置,通过key快速获得offset,再打开文件,直接定位到offset位置。

哈希表持久化

但是哈希表没有顺序的,访问不同的key时候需要随机的磁盘访问,而且哈希表冲突的时候,需要复杂的处理逻辑,还无法支持范围查询。

简单改变下,我们按照key-value对的顺序按键排序,这种格式称为排序字符串表即SSTable。


LevelDB 的SSTable存储格式

此结构将数据部分和索引部分分离,在查询的时候,不需要将整个SSTable文件都读入到内存中。而是先读入索引部分,可以通过布隆过滤,快速判断要查的key是否存在,如果不存在,就不用再读数据部分了。

索引部分的Index Block记录采用key:offset:size形式,key为每个Data Block 最小的key,offset记录Data Block的起始位置,size为每个Data Block的大小。每个Data Block采用顺序存储的方式,我们可以方便进行二分查找。

四 索引加速

如果每次都从 SSTable 中加载数据都需要从磁盘读取数据,性能比较差。所以LevelDB中设计了内存的缓存区。缓存区包括两个部分,一部分为最近使用的Index Block,另一个部分为Data Block,这样如果我们搜索的索引和数据都在内存中,就不用从磁盘中读取,提升了查询性能。

五 Level中SSTable合并

首先为什么需要SSTable合并那,那是因为,随着数据的增大,写的SSTable文件越来越多,而且随着对key的更新和删除,这种需要删除的数据越来越多,为了减少文件数量和清理无效数据,就需要进行compact,即将多个SSTable文件合并成一个SSTable文件。

SSTable 按照分层滚动合并的方式,Level DBLevel 0层最多只能保存4个SSTable,当Level 0层满了之后,我们就将它们进行多路归并,合并后的文件就是Level 1层的有序SSTable文件,

Level 0 层,SSTable层的key的范围是不交叉的,这样查询的时候,就可以通过二分查找的方式进行快速查找了。Level 1 层的SSTable 就会从Level 1 层中轮询的方式选择一个SSTable去和Level 2 层在此SSTablekey 范围内的SSTable进行文件合并,为了防止合并的占用的IO比较多,所以在生成SSTable的会判断此文件和下一层多少个SSTablekey的重合,如果超过10个就停止写入,生成新的SSTable 文件。这样每次合并SSTable文件消耗的IO也不至于太多。

SSTable合并

合并的过程中,老的SSTable文件,是不能删除的,所以就会同时存在老的SSTable文件和新的SSTable文件,导致同一份数据因为被compaction,数据最多可能膨胀到原来的2倍。

不过数据会膨胀,由于在compaction过程中,有可能同一份数据不断随着compaction过程向更高层重复写入,有多少层有可能就写入多少次,IO几倍量的增加。

六 参考

《核心索引20讲》 陈东
《数据密集型应用系统设计》 Martin Leppmann

七 诗词欣赏

我宁愿瞄准星星,
却击不中他们;
也不愿没有目标;
我宁愿去追逐目标,
却得不到它,
也不愿不曾追逐,
我宁愿去尝试却失败,
也不愿不曾尝试。
我不想活着的每一天
都在幻想如果我当初付出了更多努力
现在会怎样?
我会去放手追逐、
无论刀山火海,
我会去追逐我的命运!
你不能朝着你的梦想漫步,
你不能朝着梦想行走,
你要向它狂奔!
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