python配置镜像

配置文件为~/.config/pip/pip.conf

#临时使用镜像，单次有效
pip install -i https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple some-package
#设置清华镜像为默认源
pip config set global.index-url https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple

conda 配置镜像

conda channel配置文件为~/.condarc，如果没有condarc文件，Windows用户可先执行conda config --set show_channel_urls yes生成该文件之后再修改。linux用户可直接创建condarc文件。注意custom_channels中配置的镜像源需要在channels中引入，否则无法自动调用。需要在安装包时添加，例conda insatll -c bioncoda <package_name>

channels:
  - bioconda #引入bioconda
  - conda-forge
  - pythorch
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/

R配置镜像

设置镜像地址写入在 ~/.Rprofile

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/", BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor"))