R数据处理之长宽数据转换

100天生信-Day6

长数据和宽数据是满足不同分析的两种数据格式,可以很方便用R的reshape2包转换,代码如下:

library(reshape2)

## long -> wide
setwd("PATH")  
long <- read.csv("long.csv" , header = T)
colnames(long)
wide <- dcast(long, Gene_name ~ Cis_element)
write.csv(wide,'wide.csv',row.names = FALSE)

## wide -> long
setwd("PATH")  
wide <- read.csv("wide.csv" , header = T)
colnames(wide)
long = melt(wide, id=c("Primer"),
                  variable.name= 'FR', value.name = 'Seq')
write.csv(long,'long.csv',row.names = FALSE)

参考教程:https://cloud.tencent.com/developer/article/1369874

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