1 易混淆的概念
等位基因（alleles）
基因型（genotypes）
单倍型（Haplotype）
二倍型（Diplotype）
基因座位 VS. 等位基因
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两者的区别关键：
- 等位基因是一种（基因）变异，但等位基因座是一种（基因）坐标
- 等位基因是DNA序列， 但等位基因座只是DNA标记
- 等位基因能直接影响性状的表达， 但等位基因座不能
- 单个多态基因座位总是有大于一个等位基因
不同等位基因的三种类型：
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三者可能关系：
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遗传学发展简史
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数量性状-多基因性状
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2 群体与个体
群体的定义：
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群体与个体的却别和联系
- 群体具有时间上的延续性，个体是会死亡。
- 群体具有空间上的连续性
- 群体时个体的集成，个体是基因的集成
群体遗传学
定义：
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研究的基本问题：
- 群体的遗传结构：等位基因频率与基因型频率
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-
群体的遗传结构的变化： 影响等位基因频率的因素
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3 群体的遗传平衡
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哈代温伯格的主要内容：
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只涉及到一个常染色的位点，经过一代随机交配即可达到平衡
哈代温伯格的限制条件实际上是对三方面的限制：
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产生配子的机制
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联合配子的机制
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产生表型的机制
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一个大群体符合哈代温伯格定律，则两个基因的频率随世代的变化为：
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平衡群体：
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哈代温伯格定律的统计检验：
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哈代温伯格定律的意义：
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哈代温伯格定律的应用：
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复杂情况下的基因平率计算：
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1 最大似然法
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2 最大期望算法
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3 贝叶斯
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统计学和概率学的区别：
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4 性连锁遗传
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性连锁基因的群体平衡点：
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多于一个位点的群体遗传平衡
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D的衡量LD：
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5 连锁不平衡（LD）
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常用来度量的参数，D与D'均有缺点：
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最常用的为r^2, 其表示两个位点间连锁不平衡程度：
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6 引起连锁不平衡的原因
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1 非随机交配 （养殖家畜均是这样）
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2 影响基因频率的因素
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3 迁移 （引种非常常见，杂家在家禽和猪的商品代均是）
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4 基因交流
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5 突变
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6 选择
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7 其他
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