《生信必修课之软件安装》conda学习笔记

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下载命令：    wget空格【-c空格】<网址>

   -c continue 断点下载

安装miniconda：    bash空格<*.sh>

启动conda虚拟环境：    source空格~/miniconda3/bin/activate

设置conda源

查看conda源设置：    vim空格~/.condarc

搜索软件：    conda空格search空格<软件名>

安装软件：    conda空格install空格<软件名>【=<版本号>】【空格-y】

    -y  默认确认安装

    【 】内的内容可省略

bioconda软件查询地址：    bioconda.github.io

    Browse packages in the Bioconda channel:Available packages

查看环境变量： echo空格$PATH

退出虚拟环境：source空格deactivate

创建软链接：ln空格-s空格<源目录/源文件>空格<目标目录>

查看conda已有工作环境：    conda空格info空格--envs

新建conda的python2虚拟环境：    conda空格create空格-n空格<环境名>空格python=2

启动conda的python2虚拟环境：    conda空格activate空格<环境名>

查看conda虚拟环境下已有软件：   conda空格list

删除conda虚拟环境：

    ①conda空格remove空格-n空格<环境名>空格--all

    ②rm空格-rf空格~/miniconda3/envs/<环境名>/