肾的生理功能最重要就是“肾主藏精”，肾精主要是能够主管人体的生长发育和生殖功能，肾精有先天和后天的区别，先天的主要来自于父母，是与生俱来的，遗传父母，后天的是通过脾胃水谷精微的物质补充而形成。
先天之精和后天之精互相交融，充分发挥其生理功能，促进人体的生长发育，使人体逐渐生长成熟，具备生殖能力；所以我们讲中医补肾和固护肾精非常重要，因为如果过度性生活，房劳过度，就容易损耗肾中之精气，而导致生殖能力下降，肾精亏虚，出现一系列的问题。
从阴阳属性的区分来看，肾精又能够变化出肾阴肾阳，这同样是阴阳的互相制约、平衡，以及互相促进的关系，在不同的人体会表现出现不同的阴虚阳虚或者阴阳两虚等状态。
另外，肾主水，肾气的开阖、肾阳的蒸腾作用，都能够促进人体的津液代谢，这同样也需要脾阳以及肺的功能的配合发挥作用，这在之前讲肺和脾的功能里面就有描述过。
还有肾主纳气，能够促进肺气的收纳，对于有一些咳嗽气喘的病症，也可以从补肾纳气的方法进行治疗。
再说一说肾和人体的形体官窍之间的联系，肾主骨生髓，骨髓通于脑，人体的生长发育，骨骼的健壮、记忆力，脑力是否聪明敏捷，记忆力好不好，和肾精的关系非常密切。正因为如此，如果有一些胎儿早产，或者父母年老生育，胎儿先天的肾精不足，这一类的儿童多数会出现智力低下、生长发育迟缓的问题。
肾开窍于耳以及二阴，听力是否敏灵敏，大小便是否正常，都和肾气的推动和固摄作用联系非常密切，因此，对于很多耳鸣耳聋或者大小便失禁尿频等症状，多需要从补肾固肾固摄的方法进行治疗。
