三代测序技术包括Pacbio和Nanopore。现在越来越多的高分文章，已组装到染色体水平，从而拜托了对遗传图谱的依赖。
基因组的组装，有10X Genomic linked-reads、Bionore光学图谱和Chicago技术（体外Hic技术）。
1.10X Genomic linked-reads：能够得到跨度100kb以上的linked reads的信息，与三代组装相结合。
技术优势：1）低起始量建库，仅1ng基因组即可得到10X Genomic 文库。
2）长跨度信息：可获得100kb以上的跨度信息。
3）基因组组装质量的提升。
代表文章：1）2016年Nature上人的基因组；2)玉米Mo17
2.Bionore光学图谱：通过酶切和芯片技术对长达几百Kb的长链DNA单分子成像，在更短的时间内提供更完整的基因图谱。可应用于基因组辅助组装和SV(结构变异，structural variants)检测等方面。
技术优势：1）超长距离检测：提供大尺度的远程信息。
2) 单分子检测，无任何杂信号干扰，反映最真实的DNA信息。
3）无PCR过程、无片段化操作，保持DNA 最原始最完整的信息。
代表文章：1）2015年Nature Method，人的基因组；2）复活草，2015，Nature;3)2016 Science 大猩猩;4)BioRxiv，2016山羊。
3.Chicago 技术（Hic）：基于体外染色质的方法，依据DNA空间结构，得到基因组范围内的远距离序列信息，从而辅助基因组组装。
技术优势：1)依据DNA 空间结构，可以得到基因组范围内的远距离序列信息。
2）体外重组染色体，数据噪音小，成分纯净，组装准确性高
3）操作简单，使用效率高，应用物种广。
代表文章：1）2016Nature Biotechnology 上木薯基因组；2）蝙蝠、慈鲷鱼、鸽子、蝴蝶、黑猩猩、草原鸡、人和鳄鱼等动物学文章；3)马铃薯等植物学文章、
补充：基因组组装三种技术对比分析
