如果两个 VCF 文件中的样本出现的顺序不一样，但具有相同的样本名称，您可以使用 bcftools 的 reheader 命令来调整样本顺序。
bcftools reheader -s sample_order.txt file1.vcf -o file1_reordered.vcf
bcftools reheader -s sample_order.txt file2.vcf -o file2_reordered.vcf
2024-01-23vcftools合并vcf
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