文献信息：
标题：Taxonomic Description and Genome Sequence of Christensenella intestinihominis sp. nov., a Novel Cholesterol-Lowering Bacterium Isolated From Human Gut
中文：从人类肠道中分离出的新型降胆固醇细菌Christensenella coccinihominis sp. nov.的分类描述和基因组序列
杂志：frontier in Microbiology
时间：2021.2.22 ONLINE
单位：深圳华大生命科学研究院
on pubmed：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33692769/
摘要：
从中国深圳一名30岁健康男性的粪便样本中分离到一株革兰氏染色阴性、非孢子形成、短、直杆、不活动、专性厌氧菌株AF73-05CM02T。在37℃厌氧条件下，在PYG琼脂上培养4天后，菌落直径约为0.2 mm，呈米黄色，呈圆形。菌株AF73-05CM02T的生长温度为30 ~ 42℃，pH为6.0 ~ 8.5，最适生长温度为37 ~ 42℃，pH为7.0。16S rRNA基因序列分析表明，菌株AF73-05CM02T属于Christensenella属，与Christensenella minuta DSM 22607T序列相似性最高(98.68%)。菌株AF73-05CM02T的主要脂肪酸为C10:0(7.5%)、iso-C11:0(5.6%)、C12:0(7.2%)、C14:0(46.6%)、iso-C15:0(7.4%)、C16:0(9.7%)和C18:1 ω9c(6.9%)。葡萄糖发酵的最终产物为乙酸、甲酸、丁酸和乳酸。该菌株对过氧化氢酶、吲哚和明胶水解均呈阴性反应。基于平均核苷酸同源性(ANI)的基因组相关性分析表明，AF73-05CM02T菌株与Christensenella属其他种存在显著差异，其ANI值小于82.89%，系统发育最接近。基因组DNA中G + C含量为52.07 mol%，与克里斯滕森氏菌不同。一些生理、生化和基因型的属性区分小说相关物种的菌株,表明应变代表一种新的属Christensenella的名字Christensenella intestinihominis sp. 11月提出与应变AF73-05CM02T (= CGMCC 1.5207 t = DSM 103477 t)应变类型。接下来我们对菌株AF73-05CM02T和Christensenella minuta DSM 22067T的降胆固醇功能进行了研究，发现这两株菌株的降胆固醇能力分别为36.6和54.3%，胞外多糖含量分别为234和271 mg/L。
1 菌株AF73-05CM02T及系统发育相关种的BLAST基因相似性和ANI值(以百分比表示)
2 基于16S rRNA基因序列的最大似然系统进化树分析菌株AF73-05CM02T与相关类群代表的系统进化关系
3 CGView服务器使用默认参数获取Christensenella testinihominis sp. nov. AF73-05CM02T, Christensenella minuta DSM 22607T, Catabacter hongkonggensis HKU16T，“Christensenella massiliensis”marseile - p2438t，和“Christensenella timonensis”marseile - p2437t基因组圆形图。
4 球虫AF73-05CM02T基因组特征及与近缘种的比较
5 菌株AF73-05CM02T COG功能相关基因的分布
6 从菌株AF73-05CM02T和C. minuta DSM 22607T全基因组序列中鉴定出与生物合成通路相关的基因数量
7 AF73-05CM02T菌株与克里斯滕森氏菌帝斯曼22607T菌株之间的基因组共性
8 C. testinhominis AF73-05CM02T与最接近的参考菌株C. minta DSM 22607T表型特征比较
9 菌株AF73-05CM02T及其近缘种DSM 22607T的细胞脂肪酸组成
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