陈连福老师的安装流程
MAKER in Yandell Lab
MAKER2 注释教程推荐
必须安装
conda install Perl
conda install -c bioconda perl-bioperl
conda install -c bioconda blast
conda install -c bioconda repeatmasker
conda install -c bioconda exonerate
安装perl模块以及并行运算
cpan -i BioPerl Bit::Vector DBD::SQLite DBI Error Error::Simple File::NFSLock File::Which forks forks::shared Inline Inline::C IO::All IO::Prompt PerlIO::gzip Perl::Unsafe::Signals Proc::ProcessTable Proc::Signal threads URI::Escape
conda install -c bccp mpich2
可以运行perl Build.PL查看缺失的依赖，额这个有张补来补去的感觉，一会缺这个一会缺那个，而且perl中的包安装起来各种错误。。。
最后发现好像是因为我在conda创建的环境里面使用perl的cpan不行，那就只能使用conda安装perl的包
PERL Dependencies: MISSING
! forks::shared
! forks
! Bit::Vector
! Want
! Inline::C
! Perl::Unsafe::Signals
! Bio::Root::Version
! IO::All
External Programs: VERIFIED
External C Libraries: VERIFIED
MPI SUPPORT: ENABLED
MWAS Web Interface: DISABLED
MAKER PACKAGE: MISSING PREREQUISITES
conda库里能搜到的可以直接用conda安装还是覆盖挺全的
conda install -c bioconda perl-forks
conda install -c bioconda perl-bit-vector
