R语言基础
认识R和Rstidio
R是一种免费开源的编程语言,对于生信分析十分友好,因为它汇集了很多函数,很多包,能够大部分的下游分析,统计计算,绘图。
Rstudio 是一款R语言的IDE,因为本身R自带的环境对于操作者来说不太友好,Rstudio提供了很多调试,可视化的功能与环境,使R的使用更为方便。
基础设置
打开Rstutio后,点击Tools--global options,在general中可以设置默认的R版本,appearance里可以设置字体大小,主题等,有兴趣的可以每个选项都尝试一下。
R语言基本操作
1.设置工作目录
设置好工作目录,可以将脚本、文件、图片等都保存到该目录中,防止找不到。
getwd() #查看当前工作目录
setwd(新地址) #设置新的工作目录
或者每次新建project时,设置好名称和位置,以后每次打开都直接打开这个project即可。
2.显示文件列表
dir() #查看当前工作目录里的文件,类似于linux中的ls
3.赋值
<-是赋值,例如
x<-3 #将3赋值给x
4.删除变量
rm(变量名)
rm(list=ls())#删除所有变量