本文介绍了10X单细胞样本制备的一般方法,样本制备是一个探索的过程,特别是对一些没有测试过的物种(器官)来讲。为了建立起我们对样本制备的基本框架,下面先载一段:
- 用无菌剪刀或手术刀将组织切成2-4毫米的碎块。
- 在冰上将碎组织加入适当的缓冲液或平衡盐溶液中,清洗2-3次。这里一般会采用预冷的生理盐水/PBS/培养基等等,此外为了减少细胞损伤,还可以根据情况添加 FBS 或者 BSA。
- 加入适量的酶,并在最佳温度(通常为37°C)下孵育适当的时间,并间歇的混匀。消化时间与组织的类别很有关系,对于某些肿瘤组织或其他较致密结缔组织,消化时间4~48h, 对于容易消化的组织可以采用37℃ 震荡消化15~45min,也可以根据具体情况而定。如组织块已分散而失去块的形状,一经摇动即成细胞团或单个细胞,可 以认为已消化充分。
- 通过移液枪或研磨的方式轻轻分散细胞。这是单细胞制备至关重要的一步。过度的话,就会破坏细胞;不足的话,则会降低细胞收率。
- 通过合适的滤网过滤细胞悬液。
- 让细胞沉降并倒出多余的含酶液体。
- 洗涤并重复2-3次。在适当的培养基或缓冲液中重悬细胞。细胞碎片可以在此步通过离心初步去除,通常条件为300g 或1000~1500 rpm 的条件下 5 min。
- 使用台盼蓝或者荧光计数的方式对细胞数和细胞活性进行定量。
- 如果需要,将细胞进行原代培养。
PPT是给大家一个直观的认识:
- 细胞消化
- 细胞活性
- 细胞大小
- 杂细胞去除
- 试剂与仪器选择































































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IUPUI Center for Medical Genomics, 10X scientists, and Miltenyi hosted a workshop on Cell Preparation for Single-Cell RNA-seq Experiments