不同样本相同细胞类型之间的表达差异

同一物种的同一个组织，在不同的样本或者处理之间，相同细胞类型中基因表达的 差异分析

http://www.360doc.com/content/21/0714/12/76149697_986499764.shtml
https://zhuanlan.zhihu.com/p/601553301

1. 基于零膨胀福二项分布

1.1 MAST

GitHub: https://github.com/RGLab/MAST/

10.1186/s13059-015-0844-5

image.png

http://www.360doc.com/content/23/0314/22/76149697_1072023761.shtml

1.2 SCDE

https://hms-dbmi.github.io/scde/

10.1038/nmeth.2967

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https://www.jianshu.com/p/162c76674b3d
https://blog.csdn.net/AIPuFu/article/details/100591001

1.3 DEsingle

GitHub: https://github.com/miaozhun/DEsingle/

10.1093/bioinformatics/bty332

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https://www.jianshu.com/p/f180f4e953ac

输出结果解读：


2023-04-24 10-30-03屏幕截图.png
    1. 使用 norm_foldChange 和 pvalue.adj.FDR 做最终的判别
    1. norm_foldChange = total_mean_1/total_mean_2，注意其中的顺序

2. 基于泊松分布

2.1 BPSC

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