复现一篇Nature medicine的火山图,如下: (reference:Sex-dependent APOE4 neutrophil–mi...
接上一节(【视频教程】Cellphonedb v5更新:python版Scanpy单细胞分析后续之cpdb细胞通讯[http://mp.weix...
之前我们演示cpdb分析的时候侧重的是R分析seurat对象准备input data,小伙伴提到“我单细胞一开始就是用scanpy分析的,怎么进...
参考:https://mp.weixin.qq.com/s/x4HOHNwikvuTCRK4kQRjRA?token=971255988&lan...
这是一个集成的函数,很多小伙伴被一些美图”迷了眼“,需要这样、那样的形式。单独做又很麻烦,且容易出错。要求既要这样展示,又要那样展示。所以我们直...
这种nature\Cell都在用的富集结果展示形式: (reference:【1】Chen et al., 2020, Cell 182, 22...
图是关于互作分析受配体的展示。横轴是source cell,纵轴是受配体对,展示了每个source与其他细胞的互作,也展示了每个组之间结果。其实...
有小伙伴说想要做单细胞marker基因表达密度图,我一想,好像之前是做过的(单细胞marker基因可视化的补充---密度图与等高线图[http:...
不想做太多的前情解说了,有点累了,做了很久的内容,包括整个分析,从软件安装和报错解决到后期下游python版-R语言版下游分析和可视化!单细胞代...