发简信
IP属地：重庆
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【1:1复刻Cell】python版单细胞多组差异基因火山图可视化函数我们之前在python中1:1复刻R版火山图之后（【1:1复刻R版】python版火山图函数一键出图），群里小伙伴希望使用python复刻之前c...
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【视频教程】cNMF（Consensus NMF）：基于python的单细胞转录组数据非负矩阵分解分析R版本的NMF分析中，我们介绍了相关概念，可查看（（视频教程）NMF: 单细胞非负矩阵分解R语言版-数据降维及MetaProgram分析）。但是...
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你有这么大的样本吗？---学习张泽民院士Cell文章分析思路之单细胞丰度NMF分析2025-08-10起源是我们微信群里的小伙伴发了一张热图，需要让我复现，是一篇Cancer cell的文章，因为我们写过很多热图，所以对这个图无感，原因是看似复杂...
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Circular Plot系列(六)：【视频教程】复现SCI图表之环形图展示分组celltype基因表达circle plot精彩系列： Circular Plot系列(一): 环形热图绘制Circular Plot系列(二): 学习nature子...
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玩转单细胞(21)：复现Nature图表---单细胞亚群无监督层次聚类分析及环形树状图绘制玩转单细胞往期精彩系列： 玩转单细胞(1)---提取特定基因表达的细胞群分析（一个小问题）[http://mp.weixin.qq.com/s...
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【视频-python一键函数】：热图标注特定基因及不同颜色设置展示marker基因虽然scanpy有展示marker基因的热图函数（scanpy单细胞转录组python教程（五）：最详尽的基础可视化解析），但是有很明显的缺陷，...
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milo-基于KNN的差异丰度分析（python版miloR）之前我们推出过单细胞差异丰度分析的R包miloR（miloR：单细胞差异丰度分析）。这个方法也有python版的实现，github官网: htt...
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【奇技淫巧】：单细胞monocle2结果添加类似RNA velocity 的箭头指示拟时方向这是一篇修饰作图的内容，算是“奇技淫巧”，有一定的用处。小伙伴的脑洞和需求真的是无奇不有，是这样的，小伙伴没有跑速率（如果有了RNA 速率结果，...
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顶级精致CNS图表：单细胞marker基因表达气泡图复现SCI精致图表，单细胞marker基因表达气泡图。图的特点是左侧是cluster+celltype注释，顶部是基因注释，同时图有背景色。我们...