阴性对照设置
参考:【研究生】流式细胞术原理、荧光通道、流式图、实验对照设计等_哔哩哔哩_bilibili
同型对照选择
一般抗体购买时会给推荐相应得同型对照
参考:流式检测中同型对照与二抗及封闭剂的区别? - 知乎 (zhihu.com)
同型与一抗区别是:同型对照抗体是没有特异靶标的一抗,也就是说抗体的可变区或者说fab段(与抗原特异性结果的部位)是不一样的。其他区域是一样的。
同型对照作用:排除非特异性结合:
(1)抗体与靶细胞上的 Fc 受体结合,(2)抗体与细胞蛋白、碳水化合物和脂类的非特异性结合和。
封闭剂又叫FC受体阻断剂:意思就是,细胞表面的FC受体都是我的,你一抗别想抢,抢也抢不到。细胞上的FC受体能结合抗体的FC段,造成非特异结合。有N多种细胞的FC受体能结合FC段,但是,有三种细胞结合力相对较强,见下图,也就是表达DC64,CD32,CD16的这几种细胞(真好记,16,162=32,322=64,是巧合还是有什么我不知道的隐秘)。<img src="https://pica.zhimg.com/50/v2-c27298ce84d93aee79ec395939e6cbea_720w.jpg?source=1940ef5c" data-caption="" data-size="normal" data-rawwidth="749" data-rawheight="371" data-default-watermark-src="https://picx.zhimg.com/50/v2-11f11c58ac9a2ff62f5ac080e5f0af55_720w.jpg?source=1940ef5c" class="origin_image zh-lightbox-thumb" width="749" data-original="https://picx.zhimg.com/v2-c27298ce84d93aee79ec395939e6cbea_r.jpg?source=1940ef5c"/>
从上面来看,两者差不多,又有区别。同型抗体能与FC受体结合,但是结合能力和一抗是一样的,也就是说,也就那三种细胞结合的比较多,背景噪音比较高。其他的细胞,结合很少。而FC受体阻断剂不同,管你什么细胞的fc受体,管你有没有能力结合FC段,通通封杀,不要影响抗体兄弟。抗体与细胞蛋白、碳水化合物和脂类的非特异性结合和,这点的话,同型可以解决,封闭应该解决不了。但这种结合能结合多少?影响多大?我不知道,应该没什么影响。总结:封闭剂效果更好,表现出真实的荧光强度,同型抗体可能造成背景高,对结果可能造成影响。况且,并不是每个抗体都能找到同型抗体(理论上能)。而且,封闭剂便宜。所以说,能用封闭就封闭吧!
荧光补偿问题
参考:想了解“荧光补偿”的相关知识吗?看这里! - 知乎 (zhihu.com)
【流式集训营】FlowJo调补偿的一二式_哔哩哔哩_bilibili
哪些染料之间有荧光补偿:
1、由同一个激发光激发的荧光染料之间才会涉及补偿,例如:FITC/PE/Percp/PE-Cy5/PE-Cy7。不同激发光激发的两种荧光染料之间几乎没有补偿;例如PE和APC;
2、由同一个激发光激发的荧光染料,如果发射光谱之间有重叠部分则一定有补偿,一般而言发射光谱相邻的两种染料之间会有补偿;
3、注意耦联染料的补偿,像PE-Cy5和APC是由不同的激发光激发,但两者之间补偿太大,不能同时使用,请看如下解释:
如何调整荧光补偿呢???
参考:科学网—如何确定流式分析中荧光补偿是正确的呢? - 张千君的博文 (sciencenet.cn)
在实验时直接调补偿,可以根据自己选择的染料事先看一下BD 荧光viewer,看看发射光谱有没有重叠,简单判断是否有补偿。在做预实验时,每一个通道都要做一个单染管,用来调补偿。补偿调好后正式实验直接用就可以了,不要再改变染料的体积用量,不要改变电压,一般来说,波动不会太大的。
1. 建立普通specimen:specimen_001
新建一个experiment,在这个experiment下面建立一个specimen_001,在parameter中选择合适的通道.
2. 建立补偿specimen:compensation controls
step1:如 图1: 在顶部experiment中选择compensation setup,然后create compensation controls.
step2:如 图2:勾上include seperate unstainded controls tube/well,点击ok.
step3:如 图3:在compensation conrols下建立NC管和单阳管,并分别命名。
step4: 利用NC管调整所有marker的阴性群在10^2左边,不record数据
step5:利用单阳管调整每一个单阳管marker的阳性群在视野内,不record数据
step6:step4&5调整好每个marker的电压后,将单阳管调整好的电压分别输入NC管中。并重新loadNC管和每一个单阳管,分别record数据。
step7:计算补偿:点击顶部experiment_compensation setup_calculate compensation。
跳出页面,点击link and save。
step8:点击回到global worksheet(从normal worksheet)
再点击compensation controls实验
cytometer窗口就会出现compensation值