在对临床案例的研究中，如果对大量的心理精神疾病患者进行观察和心理分析，可以发现，心理和生理活动是有规律的，它们的组合和运行方式和电脑的程序非常相似，人的心理活动可以用类似电脑程序一样的概念来描述和类比，可以把这种心理上的程序称为“心理程序”。
在人的身体上也存在着一种操纵身体和生理活动的隐蔽的行为。这种“隐蔽的行为”和电脑“运行程序”非常相似，我们可以把这种“隐蔽的行为”看作是“运行程序”，把“隐蔽的行为”所启动的各种心理或生理活动之间的组合命名成“心理程序”。人和人之所以不同，正是因为他们有不同的内隐行为，也就是他们身体上运行着不同的心理程序，人之所以患精神病，也是因为“程序”错乱。可以通过改变一个的的内隐行为而改变他。
当我们关注“心理程序”时，会发现精神病和心理障碍的本质就是这种“心理程序”错乱，心理治疗干预这个“程序”，比改变认知疗法的“信念”和行为主义的“外部行为”效果更好，因为“信念”和“行为”也是心理程序，用“心理程序”这个名称可以统一“信念”和“行为”。
事实上，心理科学发展到今天，各大流派理论、各类心理疗法都是在朝向这个目标前进。
其中最近几年的“认知行为疗法CBT”、“网络模型”和“基于过程的治疗PBT”更是已接近心理程序这一模型。
在更早以前的心理学史上，许多经典的心理学理论也都蕴含了心理程序的思想。比如“进化心理学”，“精神分析主体间性理论”，皮亚杰的“动作图式”，以及埃瑞克森的“习惯性联结模式”，认知心理学的“执行功能”，甚至“具身认知”理论等。这些理论都或多或少都有类似的想法、观点，进化心理学中的“心理模块”，主体间理论的“独一无二的组织原则”等就是“心理程序”的雏形。
人的精神心理疾病和电脑软件故障相似，非器质性的精神心理疾病实际上是心理程序出错。心理程序和电脑程序十分相似。意识（分有意识无意识）对身体生理的操控可类比为：计算机对计算机自身以及外部设备（显示器、键盘、机械手等）的操控。
把人的精神心理活动和电脑程序的运行过程类比，认为人的心理活动的运行模式也可以描述为一组“程序”，这些程序和电脑程序一样，都是抽象非实体的，都可以建立和修改。人或其他生命的意识可以作用于生理，通过主观意志的有意识操作，可以修正、更改、消除、建立某些心理程序。
弗洛伊德的精神分析就是在寻找心理程序，只是他具体的理论有许多并不正确，但是他拉开了寻找心理程序的帷幕。在整个精神心理治疗的过程中，弗洛伊德的精神分析只能说是进行心理治疗的前半段：心理分析。但仅找到心理程序是远远不够的，要治疗精神心理疾病，还需要修改出错的心理程序。
这篇论文一开始是用案例的形式呈现心理程序的模样，后面再具体阐释心理程序的定义和内涵。论文通过把人的心理活动联合起来看成是程序，认为无论是人格还是性行为，无论是个性还是行为，都可以看成是程序。这些程序运行时会激起相应的生理反应，而程序错误或运行不当时，很容易会造成生理反应错乱，这些生理反应错乱会给人带来真实的生理上的痛苦，而为了缓解这些痛苦，患者会做出一些疯狂的行为，患者看起来便像“疯子”了。
