2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异

TMB去除同意突变与非同义突变的差异

取样一组样本去重并且去除不合格样本后剩余427例样本
其中同意第一种使用非同义突变计算
数据取一个header，看看先


image.png

第二种使用同意突变计算，计算的相关性很好


image.png

做一个T检验

先看看是不是正态-目前看还算正态


image.png

image.png

TMB的结果高于cutoff与低于cutoff


image.png

结果Pvalue=1表示两个样本的均值相同
证明去除同义突变对结果是无影响的

最后编辑于 ：
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。