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    2020-09-19-统计学反思Statistical Rethinking

    前言 最近专注于贝叶斯方法的学习,发现在强化学习领域有一本入门书籍,统计学反思 未来时间会将这本书的学习笔记持续上传至我的博客等地方 Stati...

  • 2020-08-11-体细胞calling 算法综述

    体细胞calling 算法综述 somatic single nucleotide variant calling algorithms pap...

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    2020-06-09-FACETS Testing CNV

    FACETS facets is CNV detection software with using the ascn principle in...

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    2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异

    TMB去除同意突变与非同义突变的差异 取样一组样本去重并且去除不合格样本后剩余427例样本其中同意第一种使用非同义突变计算数据取一个header...

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    2020-06-06-驱动基因

    背景 肿瘤基因组学目前面临的挑战之一是将肿瘤形成过程中所涉及的基因组变化(即驱动因素)与对癌细胞没有任何益处的基因组区分开来。癌症形成的过程中驱...

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    2020-05-18-SQL入门操作

    创建数据库文件 文件-新建连接-sqllite-新建sqllite3-数据库文件-选择存放位置 导入数据 下载文件这是数据分析师的excel实战...

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    2020-05-11Strand bias 链偏好

    Strand bias 链偏好 背景 造成链偏好的原因: 1.Local realignment目的就是将比对到indel附近的reads进行局...

  • 2020-05-11-MSI算法-msisensor计算原理

    MSI msisensor 计算msi原理 MSI突变中重复至少5次的1-5个碱基的序列。然后,使用MSIsensor msi命令,通过使用卡方...