前言 最近专注于贝叶斯方法的学习，发现在强化学习领域有一本入门书籍，统计学反思 未来时间会将这本书的学习笔记持续上传至我的博客等地方 Statistical Rethinki...
IP属地：云南
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2020-09-19-统计学反思Statistical Rethinking -
2020-08-11-体细胞calling 算法综述
体细胞calling 算法综述 somatic single nucleotide variant calling algorithms paper基本信息 paper na...
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@YangKD_ 对两种看情况是没有影响的
2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异
TMB去除同意突变与非同义突变的差异 取样一组样本去重并且去除不合格样本后剩余427例样本其中同意第一种使用非同义突变计算数据取一个header，看看先 第二种使用同意突变计...
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2020-06-09-FACETS Testing CNVFACETS facets is CNV detection software with using the ascn principle input first Let’s...
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2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异TMB去除同意突变与非同义突变的差异 取样一组样本去重并且去除不合格样本后剩余427例样本其中同意第一种使用非同义突变计算数据取一个header，看看先 第二种使用同意突变计...
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2020-06-06-驱动基因背景 肿瘤基因组学目前面临的挑战之一是将肿瘤形成过程中所涉及的基因组变化（即驱动因素）与对癌细胞没有任何益处的基因组区分开来。癌症形成的过程中驱动基因（即那些带有驱动因子变化...
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2020-05-18-SQL入门操作创建数据库文件 文件-新建连接-sqllite-新建sqllite3-数据库文件-选择存放位置 导入数据 下载文件这是数据分析师的excel实战数据的下载地址： https:...
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2020-05-11Strand bias 链偏好Strand bias 链偏好 背景 造成链偏好的原因： 1.Local realignment目的就是将比对到indel附近的reads进行局部重新比对，将比对的错误率降到...
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2020-05-11-MSI算法-msisensor计算原理
MSI msisensor 计算msi原理 MSI突变中重复至少5次的1-5个碱基的序列。然后，使用MSIsensor msi命令，通过使用卡方检验比较肿瘤和正常样品之间的读...
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学习如何分析病毒Learn to analyze data from a viral outbreak
简介 在这个疫情时间，我们来学习如何用生物信息学方法检测病毒，根据系统发育，将该病毒识别为严重急性呼吸系统综合症冠状病毒SARS-CoV的同源，covid-19基因组由大约3...
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2020-01-06 记录自己的沙雕
手贱 网上搜索了得用U盘重置系统，我尝试过拯救，但是作为一个对linux系统了解不深的人，我表示很无力，因此我考虑了自己的数据后决定重装，对习惯进行一次纠正1.以后只使用co...
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IGV截图工具，可自动化
IGV配置会有些麻烦脚本https://github.com/PdoraB/DiffPdoraBox/blob/master/IGVplot/igv_Screenshot.p...
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捡几个有意思的讲讲
广东生物信息学研讨会 学习记录
前提这次研讨会的内容很丰富，作为一个生信的初学者，一次性灌输这些内容有些太多，做个写个文章记录一下。表示听过 广东生物信息学研讨会 11月9日内容 第一讲 清华生命科学院 张...
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广东生物信息学研讨会 学习记录前提这次研讨会的内容很丰富，作为一个生信的初学者，一次性灌输这些内容有些太多，做个写个文章记录一下。表示听过 广东生物信息学研讨会 11月9日内容 第一讲 清华生命科学院 张...
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只能通过放大方格来实现不是很好弄
pheatmap 画NA值热图与 image 画三角统计分析图
前言：生物信息工作中各种热图层出不穷，介绍两种特殊的热图画法1.含有NA数据的热图 数据格式如上图所示python 中用pandas 处理一下数据 热图用R pheatmap...
